More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3122 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3122  methionine aminopeptidase  100 
 
 
252 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2853  methionine aminopeptidase  95.63 
 
 
252 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0939093  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4508  methionine aminopeptidase  75.4 
 
 
249 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3313  methionine aminopeptidase  73.28 
 
 
249 aa  394  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3189  methionine aminopeptidase  69.76 
 
 
250 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258715  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3510  methionine aminopeptidase  68.95 
 
 
249 aa  371  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1415  methionine aminopeptidase  70.16 
 
 
250 aa  371  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.342998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1201  methionine aminopeptidase  70.85 
 
 
250 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0937664  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1254  methionine aminopeptidase  69.76 
 
 
250 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3118  methionine aminopeptidase  65.73 
 
 
249 aa  347  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1552  methionine aminopeptidase  63.97 
 
 
248 aa  341  8e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950161  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4919  methionine aminopeptidase  65.73 
 
 
249 aa  340  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2427  methionine aminopeptidase, type I  47.97 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5486  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
248 aa  249  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5204  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
248 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5038  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
248 aa  249  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5054  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
248 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5448  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
248 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5601  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
248 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5535  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
248 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3875  methionine aminopeptidase  49.39 
 
 
250 aa  248  7e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5473  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 
248 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000351002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5479  methionine aminopeptidase  48.99 
 
 
248 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5154  methionine aminopeptidase  48.99 
 
 
248 aa  244  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1426  methionine aminopeptidase  46.22 
 
 
251 aa  236  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1942  methionine aminopeptidase  45.24 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1976  methionine aminopeptidase  45.24 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5626  methionine aminopeptidase  42.34 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4038  methionine aminopeptidase, type I  42.23 
 
 
253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000344084  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1965  methionine aminopeptidase, type I  41.7 
 
 
254 aa  197  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2358  methionine aminopeptidase, type I  39.04 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5698  methionine aminopeptidase, type I  39.04 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0158  methionine aminopeptidase, type I  39.68 
 
 
254 aa  194  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2959  methionine aminopeptidase, type I  39.04 
 
 
254 aa  192  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.091224  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4751  methionine aminopeptidase, type I  40.08 
 
 
247 aa  191  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0635  methionine aminopeptidase, type I  37.65 
 
 
254 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1327  methionine aminopeptidase, type I  36.44 
 
 
248 aa  182  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99409  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  35.94 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1269  methionine aminopeptidase  34.38 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210872  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  33.98 
 
 
278 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  33.98 
 
 
278 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  33.98 
 
 
278 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1553  methionine aminopeptidase  34.38 
 
 
265 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  33.59 
 
 
265 aa  168  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  34.77 
 
 
265 aa  168  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406904  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  34.38 
 
 
266 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3118  methionine aminopeptidase, type I  36.97 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0559112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2886  methionine aminopeptidase  34.77 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00071423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  33.06 
 
 
249 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  36.95 
 
 
264 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0968  methionine aminopeptidase  38.82 
 
 
283 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.940482  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1914  methionine aminopeptidase, type I  36.03 
 
 
247 aa  165  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal  0.121551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  36.95 
 
 
264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1550  methionine aminopeptidase  34.39 
 
 
262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  33.6 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  33.2 
 
 
248 aa  164  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3282  methionine aminopeptidase  33.2 
 
 
265 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000794672  hitchhiker  0.0000144576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  35.74 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  35.74 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  35.74 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  35.74 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  35.74 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0526  methionine aminopeptidase  33.86 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  35.74 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  35.74 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  35.74 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  35.74 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  34.31 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  34.31 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  34.31 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  34.31 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  34.31 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1852  methionine aminopeptidase  34.07 
 
 
280 aa  162  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  34.47 
 
 
236 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  34.47 
 
 
236 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  34.47 
 
 
236 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
264 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
264 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
264 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
264 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  36.55 
 
 
264 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  34.89 
 
 
261 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  35.74 
 
 
263 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  34.31 
 
 
248 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  34.15 
 
 
248 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  32.23 
 
 
259 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  34.31 
 
 
248 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  34.13 
 
 
251 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  34.52 
 
 
269 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  35.74 
 
 
264 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  35.74 
 
 
263 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  34.52 
 
 
269 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  32.8 
 
 
256 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  32.64 
 
 
249 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  33.07 
 
 
256 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2428  methionine aminopeptidase  33.21 
 
 
275 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3003  methionine aminopeptidase, type I  34.66 
 
 
262 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.378236  normal  0.782671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1245  methionine aminopeptidase  37.39 
 
 
282 aa  158  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.476436  normal  0.0508409 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  31.3 
 
 
257 aa  159  6e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  31.87 
 
 
258 aa  158  7e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>