More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4038 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4038  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
253 aa  525  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000344084  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0635  methionine aminopeptidase, type I  69.17 
 
 
254 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1965  methionine aminopeptidase, type I  65.75 
 
 
254 aa  368  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0158  methionine aminopeptidase, type I  62.99 
 
 
254 aa  355  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2959  methionine aminopeptidase, type I  62.06 
 
 
254 aa  354  7.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.091224  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5698  methionine aminopeptidase, type I  63.39 
 
 
254 aa  353  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2358  methionine aminopeptidase, type I  59.29 
 
 
253 aa  335  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2427  methionine aminopeptidase, type I  45.34 
 
 
248 aa  240  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5479  methionine aminopeptidase  48.39 
 
 
248 aa  238  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5473  methionine aminopeptidase  47.98 
 
 
248 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000351002 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3875  methionine aminopeptidase  47.58 
 
 
250 aa  237  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5154  methionine aminopeptidase  48.39 
 
 
248 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5486  methionine aminopeptidase  47.18 
 
 
248 aa  234  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5204  methionine aminopeptidase  47.18 
 
 
248 aa  234  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5038  methionine aminopeptidase  47.18 
 
 
248 aa  234  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5054  methionine aminopeptidase  47.18 
 
 
248 aa  234  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5601  methionine aminopeptidase  47.18 
 
 
248 aa  234  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5535  methionine aminopeptidase  47.18 
 
 
248 aa  234  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5448  methionine aminopeptidase  47.18 
 
 
248 aa  234  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1552  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 
248 aa  232  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950161  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1415  methionine aminopeptidase  45.75 
 
 
250 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.342998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1254  methionine aminopeptidase  45.75 
 
 
250 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1201  methionine aminopeptidase  44.8 
 
 
250 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0937664  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1976  methionine aminopeptidase  44.35 
 
 
252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1942  methionine aminopeptidase  44.35 
 
 
252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3189  methionine aminopeptidase  43.2 
 
 
250 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258715  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1426  methionine aminopeptidase  41.94 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3122  methionine aminopeptidase  42.23 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5626  methionine aminopeptidase  40.24 
 
 
247 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3118  methionine aminopeptidase  43.32 
 
 
249 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4919  methionine aminopeptidase  44.94 
 
 
249 aa  210  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2853  methionine aminopeptidase  42.91 
 
 
252 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0939093  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4508  methionine aminopeptidase  42.91 
 
 
249 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4751  methionine aminopeptidase, type I  44.18 
 
 
247 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1327  methionine aminopeptidase, type I  38.4 
 
 
248 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99409  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3510  methionine aminopeptidase  44.13 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3313  methionine aminopeptidase  41.3 
 
 
249 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  36.21 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  39.36 
 
 
253 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  39.36 
 
 
253 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  34.68 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1914  methionine aminopeptidase, type I  37.35 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal  0.121551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  36.99 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  34.27 
 
 
279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  36.14 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  34.41 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  35.66 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  33.2 
 
 
256 aa  163  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1154  methionine aminopeptidase  35.48 
 
 
287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  35.89 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  35.89 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  35.89 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  35.89 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  35.89 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  35.89 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  35.89 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  35.89 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  35.89 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  35.89 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  35.1 
 
 
255 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1125  methionine aminopeptidase  35.48 
 
 
287 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  35.74 
 
 
255 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  34.96 
 
 
250 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  34.96 
 
 
261 aa  160  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  36.29 
 
 
303 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  33.6 
 
 
262 aa  159  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  35.08 
 
 
249 aa  159  5e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0333  methionine aminopeptidase  33.06 
 
 
276 aa  159  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0828  methionine aminopeptidase  34.68 
 
 
267 aa  158  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.296113  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  33.59 
 
 
262 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  34.94 
 
 
274 aa  158  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  34.27 
 
 
279 aa  158  7e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  33.87 
 
 
279 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  34.27 
 
 
279 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  34.29 
 
 
251 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  33.6 
 
 
268 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  33.88 
 
 
259 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  34.01 
 
 
249 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  33.88 
 
 
251 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  34.68 
 
 
279 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  34.01 
 
 
253 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  32.66 
 
 
275 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  32.66 
 
 
277 aa  156  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  34.01 
 
 
253 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  33.47 
 
 
248 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  32.65 
 
 
250 aa  156  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10020  methionine aminopeptidase, type I  35.1 
 
 
285 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  33.87 
 
 
275 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  32.68 
 
 
266 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0644  methionine aminopeptidase  34.26 
 
 
274 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28590  putative methionine aminopeptidase  32.93 
 
 
260 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000104352 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  33.47 
 
 
281 aa  155  8e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  32.54 
 
 
258 aa  155  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2495  type I methionine aminopeptidase  32.52 
 
 
260 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  34.69 
 
 
259 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  34.8 
 
 
265 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0968  methionine aminopeptidase  34.94 
 
 
283 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.940482  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1162  methionine aminopeptidase, type I  33.6 
 
 
257 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.042748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  34.51 
 
 
258 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0054  methionine aminopeptidase  34.4 
 
 
252 aa  154  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>