More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2624 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
274 aa  558  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  71.17 
 
 
274 aa  408  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  65.3 
 
 
273 aa  348  7e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  63.81 
 
 
271 aa  343  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  61.05 
 
 
272 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  60.47 
 
 
259 aa  310  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  58.98 
 
 
258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  57.69 
 
 
272 aa  305  7e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3901  methionine aminopeptidase, type I  57.93 
 
 
281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4485  methionine aminopeptidase, type I  60.52 
 
 
286 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4293  methionine aminopeptidase, type I  57.51 
 
 
281 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143413 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 
259 aa  296  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6027  methionine aminopeptidase, type I  56.39 
 
 
279 aa  295  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  58.3 
 
 
248 aa  295  8e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  57.58 
 
 
271 aa  294  9e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0604  methionine aminopeptidase, type I  57.89 
 
 
278 aa  290  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  57.31 
 
 
256 aa  289  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  56.45 
 
 
248 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  55.02 
 
 
249 aa  280  1e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  53.2 
 
 
251 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  56.33 
 
 
249 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  55.06 
 
 
248 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3395  methionine aminopeptidase, type I  58.56 
 
 
264 aa  275  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  52.43 
 
 
277 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  54.03 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  54.03 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0649  methionine aminopeptidase, type I  51.07 
 
 
288 aa  271  7e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  53.63 
 
 
248 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  53.63 
 
 
248 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  53.63 
 
 
248 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  53.63 
 
 
248 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  55.87 
 
 
248 aa  271  8.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  53.63 
 
 
248 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  54.25 
 
 
255 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  55.74 
 
 
249 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  53.63 
 
 
248 aa  270  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  53.44 
 
 
248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  53.15 
 
 
256 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0953  methionine aminopeptidase, type I  53.76 
 
 
275 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  56.68 
 
 
248 aa  269  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  53.23 
 
 
250 aa  269  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2631  methionine aminopeptidase, type I  49.82 
 
 
277 aa  268  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1076  methionine aminopeptidase  56.76 
 
 
267 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1048  methionine aminopeptidase  56.76 
 
 
267 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1064  methionine aminopeptidase  56.76 
 
 
267 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.304445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  52.71 
 
 
269 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  56.28 
 
 
249 aa  263  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  53.59 
 
 
236 aa  262  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  48.63 
 
 
279 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  53.59 
 
 
236 aa  262  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  54.84 
 
 
250 aa  262  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  53.59 
 
 
236 aa  262  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  51.42 
 
 
248 aa  262  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3684  methionine aminopeptidase, type I  56.98 
 
 
270 aa  261  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0454054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  51.42 
 
 
249 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  51.42 
 
 
249 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  54.47 
 
 
250 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  48.24 
 
 
279 aa  259  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  53.63 
 
 
263 aa  260  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  53.23 
 
 
248 aa  259  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
249 aa  259  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2949  methionine aminopeptidase, type I  53.01 
 
 
275 aa  259  4e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1349  methionine aminopeptidase  59.28 
 
 
265 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5020  methionine aminopeptidase  58.74 
 
 
266 aa  258  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477997  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  51.69 
 
 
236 aa  258  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  53.44 
 
 
249 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  50.19 
 
 
277 aa  256  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  51.6 
 
 
251 aa  256  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20650  methionine aminopeptidase, type I  51.64 
 
 
281 aa  256  4e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.589453  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  49.81 
 
 
275 aa  254  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  52.42 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2580  methionine aminopeptidase  48.25 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
258 aa  253  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  48.3 
 
 
264 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  46.99 
 
 
251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10748  methionine aminopeptidase  53.67 
 
 
266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.657144  normal  0.278291 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  47.64 
 
 
279 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3973  methionine aminopeptidase, type I  49.21 
 
 
257 aa  252  5.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  47.83 
 
 
280 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1343  methionine aminopeptidase, type I  47.66 
 
 
256 aa  250  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1336  methionine aminopeptidase, type I  47.66 
 
 
256 aa  250  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  48.83 
 
 
275 aa  249  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  48.4 
 
 
262 aa  249  3e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
257 aa  249  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  51.42 
 
 
248 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  50.85 
 
 
236 aa  248  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  51.61 
 
 
259 aa  248  6e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  51.61 
 
 
259 aa  248  7e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  52.34 
 
 
259 aa  248  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  52.19 
 
 
251 aa  248  9e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  47.6 
 
 
266 aa  248  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  51 
 
 
251 aa  247  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  51.2 
 
 
251 aa  246  2e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  48.62 
 
 
256 aa  246  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  49.39 
 
 
247 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  44.88 
 
 
279 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  50.6 
 
 
255 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  47.58 
 
 
250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  48.58 
 
 
248 aa  245  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1955  methionine aminopeptidase, type I  50.78 
 
 
264 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>