More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1201 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1201  methionine aminopeptidase  100 
 
 
250 aa  503  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0937664  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1254  methionine aminopeptidase  92.8 
 
 
250 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1415  methionine aminopeptidase  92.4 
 
 
250 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.342998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3189  methionine aminopeptidase  82.59 
 
 
250 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258715  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3510  methionine aminopeptidase  73.68 
 
 
249 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2853  methionine aminopeptidase  70.85 
 
 
252 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0939093  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4508  methionine aminopeptidase  70.68 
 
 
249 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3122  methionine aminopeptidase  70.85 
 
 
252 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1552  methionine aminopeptidase  66.13 
 
 
248 aa  342  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950161  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3313  methionine aminopeptidase  64.37 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4919  methionine aminopeptidase  65.86 
 
 
249 aa  336  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3118  methionine aminopeptidase  65.06 
 
 
249 aa  335  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5486  methionine aminopeptidase  51.42 
 
 
248 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5204  methionine aminopeptidase  51.42 
 
 
248 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5038  methionine aminopeptidase  51.42 
 
 
248 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5054  methionine aminopeptidase  51.42 
 
 
248 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3875  methionine aminopeptidase  50.61 
 
 
250 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5448  methionine aminopeptidase  51.42 
 
 
248 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5601  methionine aminopeptidase  51.42 
 
 
248 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5535  methionine aminopeptidase  51.42 
 
 
248 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5473  methionine aminopeptidase  51.01 
 
 
248 aa  261  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000351002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5479  methionine aminopeptidase  51.01 
 
 
248 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2427  methionine aminopeptidase, type I  51.22 
 
 
248 aa  260  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5154  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 
248 aa  258  9e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1426  methionine aminopeptidase  45.75 
 
 
251 aa  235  6e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1976  methionine aminopeptidase  45.2 
 
 
252 aa  231  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1942  methionine aminopeptidase  45.2 
 
 
252 aa  231  7.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4038  methionine aminopeptidase, type I  44.8 
 
 
253 aa  223  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000344084  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5626  methionine aminopeptidase  42.74 
 
 
247 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2358  methionine aminopeptidase, type I  41.3 
 
 
253 aa  208  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1965  methionine aminopeptidase, type I  42.51 
 
 
254 aa  197  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1327  methionine aminopeptidase, type I  40.96 
 
 
248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99409  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5698  methionine aminopeptidase, type I  39.27 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0158  methionine aminopeptidase, type I  39.27 
 
 
254 aa  195  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123338  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2959  methionine aminopeptidase, type I  39.36 
 
 
254 aa  194  8.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.091224  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0635  methionine aminopeptidase, type I  38.46 
 
 
254 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4751  methionine aminopeptidase, type I  41.7 
 
 
247 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  36.99 
 
 
249 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  37.04 
 
 
248 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1914  methionine aminopeptidase, type I  40.08 
 
 
247 aa  178  8e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal  0.121551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  36.69 
 
 
260 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2421  methionine aminopeptidase, type I  36.33 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3118  methionine aminopeptidase, type I  39.66 
 
 
270 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0559112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  35.08 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  35.98 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  35.98 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  35.98 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  35.98 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2044  methionine aminopeptidase, type I  35.66 
 
 
254 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000236003  hitchhiker  0.000194463 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  35.98 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  31.85 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  35.08 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  31.85 
 
 
270 aa  171  9e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  36.17 
 
 
236 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  36.17 
 
 
236 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  35.98 
 
 
248 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  36.17 
 
 
236 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  35.98 
 
 
248 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0968  methionine aminopeptidase  37.55 
 
 
283 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.940482  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  36.25 
 
 
279 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  34.27 
 
 
255 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  34.31 
 
 
248 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1245  methionine aminopeptidase  37.96 
 
 
282 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.476436  normal  0.0508409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  32.39 
 
 
248 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  34.63 
 
 
266 aa  168  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  35.08 
 
 
260 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  35.04 
 
 
267 aa  168  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  34.94 
 
 
264 aa  168  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  34.94 
 
 
264 aa  168  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  34.94 
 
 
264 aa  168  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  34.94 
 
 
264 aa  168  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  34.94 
 
 
264 aa  168  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  34.94 
 
 
264 aa  168  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  34.94 
 
 
264 aa  168  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  34.94 
 
 
264 aa  168  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  34.94 
 
 
264 aa  168  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  36.29 
 
 
284 aa  166  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  31.89 
 
 
267 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  33.47 
 
 
248 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  35.34 
 
 
264 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  35.08 
 
 
250 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  33.2 
 
 
266 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  35.37 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  33.07 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  34.68 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  35.34 
 
 
264 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  35.34 
 
 
264 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  35.34 
 
 
264 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  34.94 
 
 
264 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  35.34 
 
 
264 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  32.81 
 
 
265 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  35.34 
 
 
264 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3209  methionine aminopeptidase, type I  36.33 
 
 
285 aa  165  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836059  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  34.15 
 
 
248 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  34.41 
 
 
279 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  34.41 
 
 
279 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0526  methionine aminopeptidase  32.93 
 
 
264 aa  166  5e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1248  methionine aminopeptidase, type I  34.4 
 
 
263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  33.74 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  34.27 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>