More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2959 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2959  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
254 aa  525  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.091224  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1965  methionine aminopeptidase, type I  71.94 
 
 
254 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0635  methionine aminopeptidase, type I  67.98 
 
 
254 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2358  methionine aminopeptidase, type I  67.98 
 
 
253 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0158  methionine aminopeptidase, type I  66.4 
 
 
254 aa  368  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5698  methionine aminopeptidase, type I  64.82 
 
 
254 aa  363  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4038  methionine aminopeptidase, type I  62.06 
 
 
253 aa  354  7.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000344084  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2427  methionine aminopeptidase, type I  43.32 
 
 
248 aa  230  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1327  methionine aminopeptidase, type I  40 
 
 
248 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99409  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1552  methionine aminopeptidase  42.57 
 
 
248 aa  215  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950161  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3875  methionine aminopeptidase  44.76 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5154  methionine aminopeptidase  43.55 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5473  methionine aminopeptidase  43.95 
 
 
248 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000351002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5479  methionine aminopeptidase  43.55 
 
 
248 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5486  methionine aminopeptidase  43.15 
 
 
248 aa  208  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5204  methionine aminopeptidase  43.15 
 
 
248 aa  208  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5038  methionine aminopeptidase  43.15 
 
 
248 aa  208  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5054  methionine aminopeptidase  43.15 
 
 
248 aa  208  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5601  methionine aminopeptidase  43.15 
 
 
248 aa  208  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5448  methionine aminopeptidase  43.15 
 
 
248 aa  208  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5535  methionine aminopeptidase  43.15 
 
 
248 aa  208  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5626  methionine aminopeptidase  40.49 
 
 
247 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1976  methionine aminopeptidase  40.48 
 
 
252 aa  205  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1942  methionine aminopeptidase  40.48 
 
 
252 aa  205  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1426  methionine aminopeptidase  39.29 
 
 
251 aa  204  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3118  methionine aminopeptidase  40.49 
 
 
249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1415  methionine aminopeptidase  40.08 
 
 
250 aa  198  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.342998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1254  methionine aminopeptidase  39.68 
 
 
250 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3189  methionine aminopeptidase  38.4 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258715  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4919  methionine aminopeptidase  41.3 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1201  methionine aminopeptidase  39.36 
 
 
250 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0937664  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3122  methionine aminopeptidase  39.04 
 
 
252 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490297  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3313  methionine aminopeptidase  41.3 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2853  methionine aminopeptidase  39.27 
 
 
252 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0939093  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4508  methionine aminopeptidase  37.65 
 
 
249 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4751  methionine aminopeptidase, type I  38.55 
 
 
247 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3510  methionine aminopeptidase  38.06 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  35.63 
 
 
279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  35.63 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  35.63 
 
 
279 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  35.6 
 
 
256 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1914  methionine aminopeptidase, type I  34.54 
 
 
247 aa  159  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.482052  normal  0.121551 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  35.89 
 
 
279 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  35.89 
 
 
249 aa  158  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  35.37 
 
 
250 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  32.94 
 
 
255 aa  156  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  35.37 
 
 
250 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  35.89 
 
 
279 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  35.48 
 
 
279 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  34.57 
 
 
249 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  33.6 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  33.73 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  33.47 
 
 
279 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  31.66 
 
 
262 aa  152  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  31.56 
 
 
250 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  32.53 
 
 
274 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  32.67 
 
 
280 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  31.84 
 
 
248 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  31.84 
 
 
248 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  31.84 
 
 
248 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  31.84 
 
 
248 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  31.84 
 
 
248 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0269  methionine aminopeptidase, type I  32.79 
 
 
249 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  32.39 
 
 
285 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  32.79 
 
 
256 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  31.84 
 
 
248 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  32.35 
 
 
236 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  35.1 
 
 
250 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  32.35 
 
 
236 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  32.35 
 
 
236 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  32.02 
 
 
277 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  34.13 
 
 
258 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  33.2 
 
 
256 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  31.84 
 
 
248 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1125  methionine aminopeptidase  32.94 
 
 
287 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  33.86 
 
 
256 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1154  methionine aminopeptidase  32.68 
 
 
287 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  32.24 
 
 
248 aa  148  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  33.2 
 
 
247 aa  148  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  31.17 
 
 
281 aa  148  8e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  33.47 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  33.47 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  33.47 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  33.47 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  33.47 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  33.47 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  33.47 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  32.92 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  33.47 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  33.47 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  30.24 
 
 
269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  33.2 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  33.2 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  33.46 
 
 
253 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  31.98 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  34.15 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  31.98 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  31.98 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  32.41 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  34.41 
 
 
248 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>