More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2925 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
256 aa  521  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0780  methionine aminopeptidase, type I  60.08 
 
 
255 aa  323  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  60.78 
 
 
249 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  59.61 
 
 
249 aa  310  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  59.61 
 
 
249 aa  310  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  59.29 
 
 
248 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  60 
 
 
248 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  56.64 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  58.89 
 
 
248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  59.06 
 
 
247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  55.51 
 
 
251 aa  296  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  56.47 
 
 
248 aa  294  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  58.04 
 
 
248 aa  293  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  55.69 
 
 
248 aa  293  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  56.08 
 
 
249 aa  291  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  54.9 
 
 
248 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  54.9 
 
 
248 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  54.9 
 
 
248 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  54.9 
 
 
248 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  54.9 
 
 
248 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  54.9 
 
 
248 aa  290  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  54.9 
 
 
248 aa  288  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  56.47 
 
 
248 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  55.73 
 
 
255 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  54.73 
 
 
236 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  54.73 
 
 
236 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  54.73 
 
 
236 aa  277  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  55.34 
 
 
249 aa  277  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  52.36 
 
 
251 aa  275  6e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  51.97 
 
 
251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  51.97 
 
 
251 aa  272  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  51.57 
 
 
277 aa  271  9e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  51.76 
 
 
249 aa  270  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3973  methionine aminopeptidase, type I  54.3 
 
 
257 aa  270  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  53.15 
 
 
274 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  53.75 
 
 
257 aa  269  4e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  51.97 
 
 
279 aa  268  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  54.94 
 
 
248 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  53.15 
 
 
256 aa  266  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  51.76 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  51.97 
 
 
275 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  50.39 
 
 
279 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  52.78 
 
 
248 aa  262  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  50 
 
 
279 aa  262  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  50 
 
 
279 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  52.53 
 
 
254 aa  262  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  51.98 
 
 
259 aa  261  6.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  50.39 
 
 
248 aa  260  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  51.57 
 
 
250 aa  259  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  51.57 
 
 
249 aa  260  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  51.17 
 
 
281 aa  259  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2580  methionine aminopeptidase  50 
 
 
290 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  48.43 
 
 
280 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  49.21 
 
 
266 aa  257  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  51.17 
 
 
271 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  49.22 
 
 
249 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  50.59 
 
 
258 aa  256  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  50.39 
 
 
250 aa  256  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  50.98 
 
 
264 aa  256  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  49.01 
 
 
254 aa  255  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0310  methionine aminopeptidase, type I  52.33 
 
 
265 aa  254  9e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0001286  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  51.04 
 
 
236 aa  254  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  46.06 
 
 
249 aa  254  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  47.64 
 
 
279 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  47.64 
 
 
279 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2043  methionine aminopeptidase, type I  47.88 
 
 
263 aa  252  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000664396  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  50.19 
 
 
273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  49.61 
 
 
250 aa  252  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  48.44 
 
 
249 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1125  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 
287 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  48.43 
 
 
303 aa  250  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1830  peptidase M24A  48.64 
 
 
260 aa  250  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  48.82 
 
 
281 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  50.62 
 
 
236 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  48.24 
 
 
265 aa  250  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  49.61 
 
 
259 aa  250  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 
275 aa  250  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  51.57 
 
 
274 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4490  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 
281 aa  249  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1154  methionine aminopeptidase  49.61 
 
 
287 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  49.62 
 
 
259 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0333  methionine aminopeptidase  48.43 
 
 
276 aa  249  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2208  methionine aminopeptidase, type I  47.67 
 
 
265 aa  248  6e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000857488  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  47.64 
 
 
262 aa  248  6e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  46.64 
 
 
255 aa  248  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2275  methionine aminopeptidase, type I  47.88 
 
 
258 aa  248  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  hitchhiker  0.00333924 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  49.01 
 
 
269 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  45.49 
 
 
268 aa  247  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  50.59 
 
 
248 aa  246  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3306  methionine aminopeptidase, type I  50.62 
 
 
236 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000948834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0955  methionine aminopeptidase, type I  50.62 
 
 
236 aa  246  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.321891  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2402  methionine aminopeptidase, type I  48.45 
 
 
265 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00167537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1489  methionine aminopeptidase  48.24 
 
 
252 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  45.1 
 
 
248 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1762  methionine aminopeptidase, type I  45.88 
 
 
272 aa  245  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  49.41 
 
 
257 aa  244  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  48.82 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>