More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10020 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_10020  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5885  methionine aminopeptidase, type I  75.27 
 
 
285 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0968  methionine aminopeptidase  75 
 
 
283 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.940482  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2191  methionine aminopeptidase, type I  74.47 
 
 
284 aa  431  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0281618  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12877  methionine aminopeptidase  73.14 
 
 
285 aa  432  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2033  methionine aminopeptidase  72.79 
 
 
285 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.081264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4070  methionine aminopeptidase  72.08 
 
 
285 aa  427  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2050  methionine aminopeptidase  72.79 
 
 
285 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208724  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2096  methionine aminopeptidase  72.79 
 
 
285 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0670638  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2272  methionine aminopeptidase  71.02 
 
 
285 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.888452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1319  methionine aminopeptidase, type I  71.93 
 
 
285 aa  425  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.123772  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1245  methionine aminopeptidase  73.48 
 
 
282 aa  421  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.476436  normal  0.0508409 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3209  methionine aminopeptidase, type I  71.79 
 
 
285 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836059  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2125  methionine aminopeptidase, type I  70.88 
 
 
287 aa  418  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18548  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3118  methionine aminopeptidase, type I  72.96 
 
 
270 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0559112  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1362  methionine aminopeptidase, type I  74.04 
 
 
285 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1412  methionine aminopeptidase type I  67.37 
 
 
298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2574  methionine aminopeptidase  70.25 
 
 
282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.900231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1692  methionine aminopeptidase, type I  70.57 
 
 
286 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00462281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1588  methionine aminopeptidase, type I  70 
 
 
292 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000312682 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1589  methionine aminopeptidase, type I  68.93 
 
 
303 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1690  methionine aminopeptidase, type I  67.62 
 
 
285 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1491  methionine aminopeptidase, type I  68.33 
 
 
293 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.717494  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3317  methionine aminopeptidase, type I  67.86 
 
 
292 aa  388  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12160  methionine aminopeptidase, type I  66.43 
 
 
286 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00879026  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15230  methionine aminopeptidase, type I  66.43 
 
 
289 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2122  methionine aminopeptidase, type I  68.2 
 
 
290 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2038  methionine aminopeptidase, type I  67.28 
 
 
275 aa  360  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.138159  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13460  methionine aminopeptidase, type I  62.64 
 
 
314 aa  349  3e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.752514  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16620  methionine aminopeptidase, type I  58.87 
 
 
295 aa  338  5.9999999999999996e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0147101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2425  methionine aminopeptidase  55.71 
 
 
328 aa  291  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519627  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  53.02 
 
 
329 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1405  methionine aminopeptidase, type I  51.96 
 
 
329 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2452  methionine aminopeptidase, type I  52.67 
 
 
329 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  50.82 
 
 
274 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  50.41 
 
 
274 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  51.02 
 
 
261 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04150  conserved hypothetical protein  47.31 
 
 
418 aa  255  6e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133775  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64750  methionine aminopeptidase  45.71 
 
 
370 aa  253  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.991291  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  49.8 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  49.59 
 
 
275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_19644  predicted protein  55 
 
 
268 aa  251  8.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00530685  normal  0.519725 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  48.82 
 
 
274 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  49.22 
 
 
279 aa  250  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  48.97 
 
 
273 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  49.02 
 
 
275 aa  248  7e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  52.03 
 
 
258 aa  248  9e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  51.23 
 
 
277 aa  248  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 
299 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  48.24 
 
 
275 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  48.44 
 
 
284 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  48.82 
 
 
278 aa  245  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  47.76 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  48.98 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  50.81 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  50.82 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  48.16 
 
 
266 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  50.41 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  50.62 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  50.62 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  47.66 
 
 
284 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  46.94 
 
 
261 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  47.47 
 
 
278 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  46.94 
 
 
261 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  49.19 
 
 
256 aa  241  9e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  47.74 
 
 
263 aa  241  9e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  48.03 
 
 
278 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1458  methionine aminopeptidase  48.43 
 
 
279 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203413 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05199  conserved hypothetical protein  45.55 
 
 
402 aa  239  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  47.35 
 
 
260 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  47.97 
 
 
258 aa  238  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  47.76 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  47.76 
 
 
260 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4466  predicted protein  41.81 
 
 
306 aa  238  8e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  47.76 
 
 
260 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  48.16 
 
 
260 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  47.5 
 
 
277 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  47.76 
 
 
260 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  47.76 
 
 
260 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  47.76 
 
 
260 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  48.16 
 
 
266 aa  236  2e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  44.67 
 
 
261 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  51.65 
 
 
255 aa  237  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12595  predicted protein  51.06 
 
 
357 aa  236  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  48.16 
 
 
260 aa  236  4e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  49.19 
 
 
262 aa  235  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  45.71 
 
 
255 aa  235  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  47.76 
 
 
258 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 
263 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 
263 aa  235  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  46.75 
 
 
264 aa  234  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  46.75 
 
 
264 aa  234  9e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  46.75 
 
 
264 aa  234  9e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  46.75 
 
 
264 aa  234  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  46.75 
 
 
264 aa  234  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  46.75 
 
 
264 aa  234  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  46.75 
 
 
264 aa  234  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  46.75 
 
 
264 aa  234  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  46.75 
 
 
264 aa  234  9e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  46.03 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>