More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2236 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
254 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  79.84 
 
 
264 aa  428  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  80.16 
 
 
259 aa  427  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2044  methionine aminopeptidase, type I  68.5 
 
 
254 aa  370  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000236003  hitchhiker  0.000194463 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0681  methionine aminopeptidase, type I  64.29 
 
 
264 aa  349  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2753  methionine aminopeptidase, type I  66.01 
 
 
254 aa  344  8.999999999999999e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  56.68 
 
 
248 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  57.26 
 
 
248 aa  288  8e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  57.6 
 
 
248 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  56.68 
 
 
251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  56.68 
 
 
248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  60.5 
 
 
236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  57.72 
 
 
248 aa  277  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0955  methionine aminopeptidase, type I  58.47 
 
 
236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.321891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  54.03 
 
 
249 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  54.03 
 
 
249 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3306  methionine aminopeptidase, type I  58.47 
 
 
236 aa  271  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000948834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  56.22 
 
 
248 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  56.72 
 
 
236 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  54.07 
 
 
248 aa  269  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  53.85 
 
 
248 aa  268  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  55.02 
 
 
249 aa  268  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  53.41 
 
 
249 aa  267  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  56.05 
 
 
269 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  50.61 
 
 
249 aa  265  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  51.42 
 
 
250 aa  264  8.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  51.22 
 
 
248 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 
248 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  54.62 
 
 
250 aa  261  8.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  52 
 
 
261 aa  256  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  50.81 
 
 
255 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 
256 aa  255  6e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  52.03 
 
 
251 aa  254  6e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  49.01 
 
 
256 aa  255  6e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  52.03 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  51.42 
 
 
249 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0768  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 
250 aa  249  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  46.83 
 
 
277 aa  249  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  48.58 
 
 
251 aa  248  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
248 aa  248  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 
251 aa  248  7e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
248 aa  248  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
248 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
248 aa  248  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
248 aa  248  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
248 aa  248  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
248 aa  248  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
248 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1955  methionine aminopeptidase, type I  53.66 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  45.28 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4490  methionine aminopeptidase  47.62 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0351  methionine aminopeptidase, type I  46.96 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  47.83 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0780  methionine aminopeptidase, type I  46.83 
 
 
255 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341129  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  45.85 
 
 
281 aa  242  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  47.15 
 
 
248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  46.64 
 
 
285 aa  242  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0333  methionine aminopeptidase  45.63 
 
 
276 aa  241  6e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  49.36 
 
 
236 aa  241  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  49.36 
 
 
236 aa  241  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  49.36 
 
 
236 aa  241  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2040  methionine aminopeptidase, type I  53.25 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0623  methionine aminopeptidase, type I  47.97 
 
 
262 aa  240  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3973  methionine aminopeptidase, type I  46.64 
 
 
257 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  43.48 
 
 
280 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  50 
 
 
254 aa  239  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  45.85 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  47.97 
 
 
257 aa  239  4e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  48.81 
 
 
281 aa  239  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  45.34 
 
 
259 aa  238  5e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  42.52 
 
 
279 aa  238  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  42.13 
 
 
279 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0269  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 
249 aa  236  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1116  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 
250 aa  236  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000848605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 
263 aa  234  8e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  46.34 
 
 
268 aa  234  8e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  49.2 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  49.2 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  48.79 
 
 
274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  42.52 
 
 
279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  45.93 
 
 
247 aa  232  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  46.56 
 
 
253 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  46.56 
 
 
253 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1924  methionine aminopeptidase, type I  52.85 
 
 
264 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  48.39 
 
 
274 aa  229  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  45.12 
 
 
249 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2580  methionine aminopeptidase  44.05 
 
 
290 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  46.15 
 
 
256 aa  229  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2275  methionine aminopeptidase, type I  45.91 
 
 
258 aa  229  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  hitchhiker  0.00333924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  43.95 
 
 
266 aa  228  7e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  48.37 
 
 
265 aa  227  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  44.72 
 
 
249 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0202  peptidase M24A  46.51 
 
 
261 aa  226  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000169894  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  45.93 
 
 
257 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  46.75 
 
 
259 aa  226  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  45.34 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  43.37 
 
 
264 aa  225  6e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1125  methionine aminopeptidase  43.65 
 
 
287 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  44.35 
 
 
250 aa  224  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  46.37 
 
 
255 aa  224  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>