More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3645 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
251 aa  521  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  63.01 
 
 
251 aa  318  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  61.13 
 
 
248 aa  315  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  55.51 
 
 
256 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  55.87 
 
 
247 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 
249 aa  278  6e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  53.04 
 
 
249 aa  278  6e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  54.47 
 
 
249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  53.09 
 
 
248 aa  270  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  48.59 
 
 
251 aa  265  4e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  48.59 
 
 
251 aa  265  4e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0780  methionine aminopeptidase, type I  50.79 
 
 
255 aa  264  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
248 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  53.09 
 
 
249 aa  263  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 
251 aa  261  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2580  methionine aminopeptidase  49.4 
 
 
290 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  51.41 
 
 
249 aa  261  8.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0310  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
265 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0001286  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2208  methionine aminopeptidase, type I  48.24 
 
 
265 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000857488  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
264 aa  259  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  48.19 
 
 
285 aa  258  4e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
248 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 
255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1830  peptidase M24A  48.83 
 
 
260 aa  258  8e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  47.39 
 
 
277 aa  258  8e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  47.98 
 
 
269 aa  258  9e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  48.19 
 
 
281 aa  257  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 
248 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 
248 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 
248 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 
248 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 
248 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 
248 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  48.37 
 
 
248 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  48.78 
 
 
248 aa  255  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 
275 aa  254  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0681  methionine aminopeptidase, type I  46.94 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  47.97 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  49.59 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  50.64 
 
 
236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0202  peptidase M24A  48.24 
 
 
261 aa  253  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000169894  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  46.18 
 
 
250 aa  252  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 
248 aa  252  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  46.99 
 
 
274 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  48.8 
 
 
264 aa  251  9.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  46 
 
 
250 aa  250  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  48.19 
 
 
280 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
257 aa  249  3e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  47.15 
 
 
248 aa  249  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2402  methionine aminopeptidase, type I  47.06 
 
 
265 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00167537  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1955  methionine aminopeptidase, type I  47.13 
 
 
264 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  48.58 
 
 
254 aa  248  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  45.6 
 
 
250 aa  248  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0333  methionine aminopeptidase  46.18 
 
 
276 aa  248  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2043  methionine aminopeptidase, type I  46.48 
 
 
263 aa  248  6e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000664396  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  47.97 
 
 
249 aa  248  8e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  48.94 
 
 
236 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  48.94 
 
 
236 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  48.94 
 
 
236 aa  248  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2275  methionine aminopeptidase, type I  46.09 
 
 
258 aa  248  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  hitchhiker  0.00333924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2040  methionine aminopeptidase, type I  46.72 
 
 
264 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  47.98 
 
 
259 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  46.59 
 
 
279 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  47.39 
 
 
303 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  46.59 
 
 
279 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  46.59 
 
 
279 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  46.18 
 
 
279 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  47.97 
 
 
248 aa  245  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  43.78 
 
 
249 aa  245  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4490  methionine aminopeptidase  46.99 
 
 
281 aa  245  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  46.18 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  44.58 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  47.24 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  44.98 
 
 
259 aa  243  3e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  46.34 
 
 
249 aa  242  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1154  methionine aminopeptidase  45.38 
 
 
287 aa  241  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  46.56 
 
 
273 aa  241  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0768  methionine aminopeptidase, type I  46.56 
 
 
250 aa  241  7e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1125  methionine aminopeptidase  45.38 
 
 
287 aa  241  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  45.27 
 
 
256 aa  240  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  48.51 
 
 
236 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  46.59 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  44.58 
 
 
250 aa  238  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  45.97 
 
 
271 aa  238  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1924  methionine aminopeptidase, type I  47.54 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3973  methionine aminopeptidase, type I  47.04 
 
 
257 aa  238  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2044  methionine aminopeptidase, type I  46.15 
 
 
254 aa  238  8e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000236003  hitchhiker  0.000194463 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  46.64 
 
 
262 aa  237  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  45.93 
 
 
265 aa  235  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0351  methionine aminopeptidase, type I  45.53 
 
 
254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  44.44 
 
 
259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  43.95 
 
 
253 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  43.95 
 
 
253 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  43.5 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1762  methionine aminopeptidase, type I  44.86 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  46.34 
 
 
261 aa  233  3e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  43.37 
 
 
274 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  44.13 
 
 
266 aa  232  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  45.12 
 
 
249 aa  231  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>