More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3684 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3684  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 		 270 aa  540  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0454054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3395  methionine aminopeptidase, type I  80.46 
 
 		 264 aa  403  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5020  methionine aminopeptidase  75.1 
 
 		 266 aa  362  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477997  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10748  methionine aminopeptidase  75.19 
 
 		 266 aa  354  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.657144  normal  0.278291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1349  methionine aminopeptidase  75.29 
 
 		 265 aa  354  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1048  methionine aminopeptidase  73.26 
 
 		 267 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1076  methionine aminopeptidase  73.26 
 
 		 267 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1064  methionine aminopeptidase  73.26 
 
 		 267 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.304445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  66.93 
 
 		 259 aa  344  8e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  63.1 
 
 		 258 aa  322  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  59.46 
 
 		 273 aa  299  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  56.98 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  59.07 
 
 		 274 aa  285  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4293  methionine aminopeptidase, type I  56.11 
 
 		 281 aa  270  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143413 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3901  methionine aminopeptidase, type I  54.96 
 
 		 281 aa  268  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  52.9 
 
 		 272 aa  268  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4485  methionine aminopeptidase, type I  57.87 
 
 		 286 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  52.51 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  53.6 
 
 		 256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  50.77 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 		 248 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  48.41 
 
 		 262 aa  245  4.9999999999999997e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  49.6 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  50.76 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  49.02 
 
 		 249 aa  240  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20650  methionine aminopeptidase, type I  52.73 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.589453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6027  methionine aminopeptidase, type I  51.55 
 
 		 279 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  48.61 
 
 		 251 aa  238  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0649  methionine aminopeptidase, type I  50.19 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0953  methionine aminopeptidase, type I  47.97 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  51.19 
 
 		 248 aa  236  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  50.39 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  46.43 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  46.43 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  51.19 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  47.2 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0604  methionine aminopeptidase, type I  49.22 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  44.66 
 
 		 279 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  46.99 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 		 251 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1149  methionine aminopeptidase, type I  49.05 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  48.02 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  46.4 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  44.66 
 
 		 279 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  46.4 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  47.1 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0710  methionine aminopeptidase, type I  49.61 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  51.75 
 
 		 271 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2631  methionine aminopeptidase, type I  48.84 
 
 		 277 aa  222  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  47.52 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  47.52 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  47.52 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  47.33 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3438  methionine aminopeptidase, type I  51.14 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000686227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  44.66 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  49.42 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  47.62 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  43.51 
 
 		 279 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  44.7 
 
 		 280 aa  218  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0906  methionine aminopeptidase, type I  48.05 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  43.3 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  45.8 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  44.06 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  46.43 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  45.45 
 
 		 265 aa  215  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  43.68 
 
 		 279 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  46.36 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  45.91 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  43.85 
 
 		 261 aa  215  8e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  49.2 
 
 		 248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  46.99 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  46.99 
 
 		 249 aa  212  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1162  methionine aminopeptidase, type I  44.19 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.042748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  47.2 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  48.98 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  44.06 
 
 		 303 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  42.69 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  48 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  40.3 
 
 		 264 aa  209  5e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  42.86 
 
 		 248 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0351  methionine aminopeptidase, type I  42.13 
 
 		 254 aa  209  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  44.06 
 
 		 281 aa  208  8e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  42.46 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  42.46 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  47.23 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1955  methionine aminopeptidase, type I  48.24 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2040  methionine aminopeptidase, type I  48.24 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  43.13 
 
 		 275 aa  205  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2666  methionine aminopeptidase, type I  47.84 
 
 		 275 aa  205  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  41.89 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1762  methionine aminopeptidase, type I  42.28 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>