More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6027 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6027  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
279 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0604  methionine aminopeptidase, type I  84.53 
 
 
278 aa  463  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  61.65 
 
 
272 aa  321  9.000000000000001e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  59.7 
 
 
277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  58.62 
 
 
272 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  59.55 
 
 
271 aa  308  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  59.7 
 
 
274 aa  301  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4485  methionine aminopeptidase, type I  62.88 
 
 
286 aa  301  7.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4293  methionine aminopeptidase, type I  60.51 
 
 
281 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  56.39 
 
 
274 aa  295  6e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3901  methionine aminopeptidase, type I  61.31 
 
 
281 aa  292  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  59.16 
 
 
273 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  58.33 
 
 
271 aa  286  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  52.12 
 
 
258 aa  268  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 
248 aa  258  9e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  52.69 
 
 
259 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
250 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20650  methionine aminopeptidase, type I  51.13 
 
 
281 aa  249  5e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.589453  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0953  methionine aminopeptidase, type I  50.19 
 
 
275 aa  248  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  50.8 
 
 
248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  48.79 
 
 
249 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0649  methionine aminopeptidase, type I  49.82 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
249 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  47.97 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 
259 aa  241  7.999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  48.19 
 
 
248 aa  241  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2631  methionine aminopeptidase, type I  50.18 
 
 
277 aa  240  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  51.41 
 
 
256 aa  238  9e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  47.04 
 
 
256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  45.16 
 
 
249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  45.16 
 
 
249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  45.78 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0710  methionine aminopeptidase, type I  51.11 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  49.59 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  47.45 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  48.4 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  47.81 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  48.39 
 
 
255 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1149  methionine aminopeptidase, type I  48.21 
 
 
287 aa  232  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  46.75 
 
 
249 aa  232  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  46.06 
 
 
277 aa  232  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29520  methionine aminopeptidase, type I  49.46 
 
 
279 aa  231  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.938726  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  46.3 
 
 
281 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  46.61 
 
 
250 aa  229  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  44.94 
 
 
248 aa  229  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1048  methionine aminopeptidase  52.87 
 
 
267 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1076  methionine aminopeptidase  52.87 
 
 
267 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1064  methionine aminopeptidase  52.87 
 
 
267 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.304445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  44.35 
 
 
251 aa  229  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  45.12 
 
 
249 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  41.47 
 
 
279 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3395  methionine aminopeptidase, type I  51.16 
 
 
264 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  44.49 
 
 
275 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2275  methionine aminopeptidase, type I  45.88 
 
 
258 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  hitchhiker  0.00333924 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  45.56 
 
 
247 aa  227  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  47.76 
 
 
248 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  45.97 
 
 
248 aa  226  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  48.8 
 
 
251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  46.37 
 
 
249 aa  225  6e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  45.53 
 
 
285 aa  225  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4368  methionine aminopeptidase, type I  48.02 
 
 
255 aa  225  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0161159  normal  0.339604 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  47.97 
 
 
251 aa  224  8e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  43.36 
 
 
280 aa  224  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  44.53 
 
 
303 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  46.94 
 
 
248 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  43.95 
 
 
248 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  46.53 
 
 
248 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  45.82 
 
 
265 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2949  methionine aminopeptidase, type I  49.81 
 
 
275 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  46.53 
 
 
248 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  46.53 
 
 
248 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  46.53 
 
 
248 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  46.53 
 
 
248 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  46.53 
 
 
248 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2402  methionine aminopeptidase, type I  45.1 
 
 
265 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00167537  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  42.58 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0333  methionine aminopeptidase  44.09 
 
 
276 aa  222  4.9999999999999996e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  40.7 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  40.31 
 
 
279 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  44.15 
 
 
264 aa  221  7e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  44.8 
 
 
250 aa  221  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  47.37 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  42.19 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  46.12 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2208  methionine aminopeptidase, type I  46.27 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000857488  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  42.19 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  46.22 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4490  methionine aminopeptidase  42.29 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
255 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  43.95 
 
 
249 aa  219  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2043  methionine aminopeptidase, type I  44.71 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000664396  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  45.42 
 
 
261 aa  219  5e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0955  methionine aminopeptidase, type I  46.22 
 
 
236 aa  219  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.321891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  46.37 
 
 
248 aa  218  7e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3438  methionine aminopeptidase, type I  49.22 
 
 
264 aa  218  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000686227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  46.34 
 
 
248 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2580  methionine aminopeptidase  43.31 
 
 
290 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1154  methionine aminopeptidase  43.87 
 
 
287 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  46.41 
 
 
236 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>