More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1088 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
236 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  72.46 
 
 
236 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0955  methionine aminopeptidase, type I  69.92 
 
 
236 aa  350  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.321891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  71.19 
 
 
248 aa  348  4e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3306  methionine aminopeptidase, type I  69.07 
 
 
236 aa  344  8.999999999999999e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000948834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  66.95 
 
 
248 aa  333  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  64.83 
 
 
249 aa  329  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  63.56 
 
 
248 aa  319  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  63.98 
 
 
248 aa  310  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  60.43 
 
 
248 aa  293  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  57.45 
 
 
251 aa  290  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  57.87 
 
 
248 aa  288  7e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  58.9 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  58.9 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  58.9 
 
 
248 aa  284  9e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  57.2 
 
 
249 aa  279  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
248 aa  279  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
248 aa  279  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
248 aa  279  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
248 aa  279  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
248 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
236 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  58.05 
 
 
269 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
248 aa  279  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
248 aa  279  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
236 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  53.39 
 
 
236 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  55.93 
 
 
249 aa  278  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  55.98 
 
 
248 aa  278  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  55.98 
 
 
248 aa  278  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  58.82 
 
 
264 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  52.12 
 
 
248 aa  276  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  57.87 
 
 
259 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  52.97 
 
 
248 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  54.89 
 
 
249 aa  271  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  56.72 
 
 
254 aa  269  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  54.85 
 
 
250 aa  268  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  54.24 
 
 
251 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  54.24 
 
 
251 aa  267  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  51.49 
 
 
250 aa  264  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2044  methionine aminopeptidase, type I  52.74 
 
 
254 aa  263  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000236003  hitchhiker  0.000194463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  54.59 
 
 
263 aa  263  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  53.81 
 
 
251 aa  262  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  52.14 
 
 
255 aa  262  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  53.62 
 
 
250 aa  260  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2753  methionine aminopeptidase, type I  55.88 
 
 
254 aa  259  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1955  methionine aminopeptidase, type I  55.74 
 
 
264 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  54.04 
 
 
249 aa  259  3e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  51.69 
 
 
274 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  52.56 
 
 
247 aa  258  6e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  50.64 
 
 
250 aa  258  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1116  methionine aminopeptidase, type I  52.77 
 
 
250 aa  256  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000848605  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  53.19 
 
 
248 aa  256  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  53.62 
 
 
256 aa  256  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2040  methionine aminopeptidase, type I  54.47 
 
 
264 aa  255  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  51.04 
 
 
256 aa  254  8e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0681  methionine aminopeptidase, type I  52.14 
 
 
264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  49.79 
 
 
259 aa  248  6e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  52.54 
 
 
255 aa  247  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0351  methionine aminopeptidase, type I  46.81 
 
 
254 aa  246  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  47.9 
 
 
273 aa  245  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1924  methionine aminopeptidase, type I  54.89 
 
 
264 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  52.63 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  48.32 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  50.83 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0780  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
255 aa  242  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  47.46 
 
 
249 aa  241  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  47.44 
 
 
249 aa  241  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  50.21 
 
 
259 aa  241  6e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  48.32 
 
 
272 aa  241  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  46.15 
 
 
249 aa  241  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  48.51 
 
 
251 aa  240  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  48.55 
 
 
258 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  47.48 
 
 
279 aa  238  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  50.63 
 
 
262 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  48.51 
 
 
253 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  47.48 
 
 
279 aa  238  8e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  49.12 
 
 
257 aa  237  9e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  46.41 
 
 
272 aa  237  9e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
261 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  48.94 
 
 
253 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  48.94 
 
 
253 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  48.31 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  46.52 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  48.09 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  47.86 
 
 
270 aa  232  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  47.86 
 
 
259 aa  232  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  46.64 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0935  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
265 aa  232  5e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.976689  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  46.84 
 
 
250 aa  231  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  47.03 
 
 
251 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0768  methionine aminopeptidase, type I  45.8 
 
 
250 aa  231  7.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  47.46 
 
 
250 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  47.46 
 
 
250 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  48.09 
 
 
260 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  46.64 
 
 
277 aa  230  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  46.89 
 
 
259 aa  229  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  47.44 
 
 
265 aa  229  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  48.51 
 
 
260 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0623  methionine aminopeptidase, type I  45.73 
 
 
262 aa  229  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>