More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3395 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3395  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
264 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3684  methionine aminopeptidase, type I  80.46 
 
 
270 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0454054  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1076  methionine aminopeptidase  74.13 
 
 
267 aa  349  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1048  methionine aminopeptidase  74.13 
 
 
267 aa  349  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1064  methionine aminopeptidase  74.13 
 
 
267 aa  349  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.304445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1349  methionine aminopeptidase  75.19 
 
 
265 aa  345  6e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10748  methionine aminopeptidase  72.03 
 
 
266 aa  343  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.657144  normal  0.278291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5020  methionine aminopeptidase  72.69 
 
 
266 aa  340  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477997  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04200  methionine aminopeptidase, type I  66.27 
 
 
259 aa  332  5e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.960695  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  62.3 
 
 
258 aa  313  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  58.56 
 
 
274 aa  289  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  55.98 
 
 
273 aa  280  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  57.09 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  54.05 
 
 
272 aa  270  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  53.28 
 
 
271 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4485  methionine aminopeptidase, type I  57.87 
 
 
286 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  54.51 
 
 
272 aa  261  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4293  methionine aminopeptidase, type I  54.17 
 
 
281 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143413 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3901  methionine aminopeptidase, type I  53.05 
 
 
281 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  49.21 
 
 
248 aa  248  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20650  methionine aminopeptidase, type I  55.25 
 
 
281 aa  246  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.589453  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0604  methionine aminopeptidase, type I  52.33 
 
 
278 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  51.81 
 
 
256 aa  240  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0953  methionine aminopeptidase, type I  50.75 
 
 
275 aa  238  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6027  methionine aminopeptidase, type I  51.16 
 
 
279 aa  238  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  49.21 
 
 
248 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  49.2 
 
 
248 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  50.79 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  47.79 
 
 
249 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  47.62 
 
 
262 aa  233  3e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3438  methionine aminopeptidase, type I  52.85 
 
 
264 aa  231  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000686227  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  46.43 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  46.43 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0649  methionine aminopeptidase, type I  51.53 
 
 
288 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  50.2 
 
 
251 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0328  methionine aminopeptidase, type I  51.36 
 
 
271 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276708  decreased coverage  0.000433341 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 
259 aa  230  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1149  methionine aminopeptidase, type I  49.81 
 
 
287 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  47.79 
 
 
255 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  47.64 
 
 
249 aa  229  4e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
251 aa  229  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  47.88 
 
 
256 aa  228  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2631  methionine aminopeptidase, type I  50.96 
 
 
277 aa  228  9e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  48.81 
 
 
251 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  46 
 
 
251 aa  223  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  46.43 
 
 
248 aa  223  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0710  methionine aminopeptidase, type I  51.92 
 
 
270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0906  methionine aminopeptidase, type I  49.61 
 
 
255 aa  221  7e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238805  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1208  methionine aminopeptidase type I  48.09 
 
 
277 aa  221  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0033542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  45.78 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  44.18 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  46.54 
 
 
277 aa  219  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  47.04 
 
 
249 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  43.78 
 
 
248 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  43.78 
 
 
248 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  43.78 
 
 
248 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  43.78 
 
 
248 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  43.78 
 
 
248 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  41.98 
 
 
279 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  42.53 
 
 
279 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  43.78 
 
 
248 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  42.53 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  47.27 
 
 
281 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  41.76 
 
 
279 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  46.43 
 
 
249 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  42.96 
 
 
279 aa  215  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  43.89 
 
 
280 aa  214  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  44.05 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  44.81 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  46.46 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  41.76 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  44.81 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  44.81 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  45.04 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  43.25 
 
 
266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2666  methionine aminopeptidase, type I  48.81 
 
 
275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  47.22 
 
 
251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2949  methionine aminopeptidase, type I  48.81 
 
 
275 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  45.6 
 
 
257 aa  211  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  46.99 
 
 
249 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  47.88 
 
 
269 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  47.41 
 
 
248 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  44.66 
 
 
281 aa  210  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  43.89 
 
 
303 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  42.06 
 
 
248 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4376  methionine aminopeptidase, type I  48.66 
 
 
255 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3306  methionine aminopeptidase, type I  48.13 
 
 
236 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000948834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  44.05 
 
 
265 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  45.6 
 
 
259 aa  205  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  42.31 
 
 
275 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  45.6 
 
 
250 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1762  methionine aminopeptidase, type I  41.37 
 
 
272 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  41.67 
 
 
268 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3121  methionine aminopeptidase, type I  50.19 
 
 
276 aa  202  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  39.37 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  42.31 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1946  methionine aminopeptidase, type I  42.47 
 
 
258 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000225398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  42.8 
 
 
270 aa  199  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1955  methionine aminopeptidase, type I  48.59 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>