58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3274 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3274  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2802  hypothetical protein  64.49 
 
 		 219 aa  298  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3512  hypothetical protein  53.52 
 
 		 223 aa  254  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0582986  normal  0.284426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1205  hypothetical protein  44.34 
 
 		 221 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1616  iron-sulfur cluster-binding protein  43.06 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3188  ferredoxin  40.57 
 
 		 588 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2147  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.57 
 
 		 562 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2641  iron-sulfur cluster-binding protein  40.57 
 
 		 599 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4908  hypothetical protein  40.38 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1070  AIG2 family protein  30 
 
 		 330 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  26.5 
 
 		 274 aa  48.9  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  29.63 
 
 		 278 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5479  methionine aminopeptidase  26.95 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2420  peptidase M24  27.34 
 
 		 422 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  26.34 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5154  methionine aminopeptidase  25.75 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3875  methionine aminopeptidase  25.75 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  24.35 
 
 		 281 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4232  peptidase M24  27.86 
 
 		 422 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3838  peptidase M24  25.78 
 
 		 422 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3765  peptidase M24  25.78 
 
 		 422 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3777  peptidase M24  25.78 
 
 		 422 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.312064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  25.4 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0086  methionine aminopeptidase  26.5 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  25.4 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  26.6 
 
 		 278 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0478  peptidase M24  28 
 
 		 359 aa  46.2  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5473  methionine aminopeptidase  25.75 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000351002 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5535  methionine aminopeptidase  25.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5486  methionine aminopeptidase  25.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  28.28 
 
 		 380 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5448  methionine aminopeptidase  25.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5204  methionine aminopeptidase  25.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5038  methionine aminopeptidase  25.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5054  methionine aminopeptidase  25.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0158  methionine aminopeptidase, type I  27.01 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5601  methionine aminopeptidase  25.75 
 
 		 248 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  26.06 
 
 		 266 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  23.33 
 
 		 253 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  23.33 
 
 		 253 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0463  peptidase M24  28.43 
 
 		 374 aa  45.1  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00525602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  24.29 
 
 		 356 aa  45.1  0.0008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  24.38 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  24.76 
 
 		 299 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  26.67 
 
 		 388 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  32.89 
 
 		 400 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  24.64 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4038  methionine aminopeptidase, type I  25.29 
 
 		 253 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000344084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  24.86 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  22.89 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  25.95 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5698  methionine aminopeptidase, type I  24.53 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.475075  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  23.28 
 
 		 256 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0635  methionine aminopeptidase, type I  28.33 
 
 		 254 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  28.11 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04150  conserved hypothetical protein  28.21 
 
 		 418 aa  42  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  25.61 
 
 		 254 aa  42  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  23.84 
 
 		 253 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>