20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3512 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3512  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  458  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0582986  normal  0.284426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2802  hypothetical protein  58.26 
 
 
219 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236486  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3274  iron-sulfur cluster-binding protein  53.52 
 
 
220 aa  254  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0807289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3188  ferredoxin  46.05 
 
 
588 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2641  iron-sulfur cluster-binding protein  45.16 
 
 
599 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1205  hypothetical protein  42.86 
 
 
221 aa  198  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2147  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.28 
 
 
562 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4908  hypothetical protein  43.58 
 
 
219 aa  184  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1616  iron-sulfur cluster-binding protein  44.19 
 
 
228 aa  182  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1070  AIG2 family protein  28.7 
 
 
330 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.739308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5154  methionine aminopeptidase  25.85 
 
 
248 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  25.49 
 
 
356 aa  46.2  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2197  methionine aminopeptidase, type I  28.43 
 
 
297 aa  45.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00985677  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  23.81 
 
 
409 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  27.11 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13460  methionine aminopeptidase, type I  26.49 
 
 
314 aa  42.4  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.752514  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3118  methionine aminopeptidase, type I  25.16 
 
 
270 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0559112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  26.53 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3875  methionine aminopeptidase  28.85 
 
 
250 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3209  methionine aminopeptidase, type I  23.68 
 
 
285 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>