More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2844 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2844  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 331 aa  642    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0556143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1914  transcriptional regulator, LacI family  47.27 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.04666  normal  0.595127 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  30.45 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  35.09 
 
 		 342 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  34.9 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  28.31 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.88 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  35.65 
 
 		 335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.88 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  29.77 
 
 		 355 aa  145  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  35.1 
 
 		 348 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  31.93 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.97 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0834  LacI family transcription regulator  35.8 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1599  LacI family transcription regulator  28.04 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  32.9 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  31.47 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.31 
 
 		 376 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  26.71 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  28.74 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  33.76 
 
 		 340 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  33.76 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.51 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  30.59 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2404  transcriptional regulator, LacI family  34.68 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000976758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6931  transcriptional regulator, LacI family  35.92 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  33.14 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  30.26 
 
 		 332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.79 
 
 		 341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  32.54 
 
 		 334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  31.76 
 
 		 349 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  31.66 
 
 		 354 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2332  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 349 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.68 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  29.68 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  31.79 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1025  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  31.27 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  30.4 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  36.59 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  35.02 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0159  transcriptional regulator, LacI family  31.45 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.169284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  30.98 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  31.9 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0329  LacI family transcription regulator  29.55 
 
 		 347 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16025  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.61 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.33 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 346 aa  132  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  31.78 
 
 		 352 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 339 aa  131  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  31.56 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0495  LacI family transcription regulator  31.29 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.51 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  26.51 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.51 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.51 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  27 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  26.51 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.51 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.51 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.51 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0466  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.59 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  27.27 
 
 		 346 aa  129  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3256  LacI family transcription regulator  35.1 
 
 		 369 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  31.43 
 
 		 336 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  27.21 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  31.19 
 
 		 333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  31.86 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.89 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3380  transcriptional regulator PtxS  32.54 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0880  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.38 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.59 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.59 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  28.75 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.59 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1691  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0314799  normal  0.084893 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2564  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  26.88 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  31.38 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  31.08 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.38 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.59 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.59 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.71 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  35.83 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>