More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1704 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1704  Arabinose-5-phosphate isomerase  100 
 
 		 205 aa  397  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  53.16 
 
 		 320 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  51.05 
 
 		 326 aa  185  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  50.79 
 
 		 318 aa  184  6e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  50.26 
 
 		 320 aa  184  8e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  52.63 
 
 		 321 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  50.52 
 
 		 315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  50 
 
 		 315 aa  181  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  50 
 
 		 315 aa  181  7e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  52.11 
 
 		 329 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  50.53 
 
 		 324 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  50.53 
 
 		 324 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.58 
 
 		 321 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  49.74 
 
 		 322 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 321 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  50.53 
 
 		 321 aa  175  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  53.7 
 
 		 319 aa  175  4e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  49.21 
 
 		 322 aa  174  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  53.01 
 
 		 323 aa  174  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  49.47 
 
 		 324 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  51.03 
 
 		 329 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  49.75 
 
 		 326 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  47.62 
 
 		 320 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  48.95 
 
 		 326 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  49.47 
 
 		 324 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  47.37 
 
 		 310 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  50.25 
 
 		 339 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  50.53 
 
 		 322 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  47 
 
 		 344 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  48.42 
 
 		 324 aa  171  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  48.42 
 
 		 324 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  46.99 
 
 		 320 aa  171  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  46.99 
 
 		 320 aa  171  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  48.72 
 
 		 330 aa  170  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1886  arabinose 5-phosphate isomerase  47.4 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106886  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  49.73 
 
 		 323 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  48.42 
 
 		 310 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  50.56 
 
 		 324 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  51.87 
 
 		 325 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  50.56 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  47.89 
 
 		 323 aa  168  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5916  KpsF/GutQ family protein  49.47 
 
 		 310 aa  167  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  50.53 
 
 		 310 aa  167  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  45.83 
 
 		 332 aa  167  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  47.42 
 
 		 323 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  46.84 
 
 		 324 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1281  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 334 aa  166  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  48.47 
 
 		 330 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  46.84 
 
 		 323 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  47.92 
 
 		 333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  47.92 
 
 		 333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  50.25 
 
 		 339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  48.72 
 
 		 330 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  48.95 
 
 		 317 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  48.29 
 
 		 331 aa  165  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  52.47 
 
 		 325 aa  164  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  48.99 
 
 		 333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0064  KpsF/GutQ family protein  46.56 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  50.52 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  47.89 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  48.91 
 
 		 325 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4201  KpsF/GutQ family protein  49.46 
 
 		 333 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.899261  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  50.84 
 
 		 325 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.68 
 
 		 328 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.68 
 
 		 328 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  48.68 
 
 		 328 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.68 
 
 		 328 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.68 
 
 		 328 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  48.68 
 
 		 328 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  46.91 
 
 		 323 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.68 
 
 		 328 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  49.48 
 
 		 333 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.68 
 
 		 328 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.15 
 
 		 328 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  48.63 
 
 		 321 aa  161  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  50.6 
 
 		 325 aa  161  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  47.34 
 
 		 330 aa  161  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  46.32 
 
 		 330 aa  160  8.000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  49.48 
 
 		 335 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  46.74 
 
 		 325 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6257  KpsF/GutQ family protein  56.44 
 
 		 311 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  46 
 
 		 334 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  45.79 
 
 		 330 aa  159  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.15 
 
 		 328 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.15 
 
 		 328 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.15 
 
 		 328 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  51.85 
 
 		 325 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  51.85 
 
 		 325 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  51.85 
 
 		 325 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  51.23 
 
 		 325 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  51.85 
 
 		 325 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.15 
 
 		 328 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.15 
 
 		 328 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  48 
 
 		 330 aa  158  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6185  KpsF/GutQ family protein  53.09 
 
 		 291 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  44.06 
 
 		 340 aa  158  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  48.22 
 
 		 332 aa  157  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.81 
 
 		 328 aa  157  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  50.31 
 
 		 326 aa  157  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.21 
 
 		 357 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>