More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0795 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3430  AAA family ATPase  48.61 
 
 
867 aa  763    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0706  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  99.9 
 
 
956 aa  1905    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2080  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  99.79 
 
 
956 aa  1903    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1895  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  92.26 
 
 
947 aa  1708    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3559  type VI secretion ATPase  48.61 
 
 
862 aa  762    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0795  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  100 
 
 
956 aa  1907    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1037  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  99.78 
 
 
889 aa  1764    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0742  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  99.78 
 
 
889 aa  1764    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  42.22 
 
 
902 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  42.78 
 
 
902 aa  635  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.66 
 
 
909 aa  631  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  42.13 
 
 
885 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  42.13 
 
 
885 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  41.9 
 
 
891 aa  629  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  42.45 
 
 
918 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  41.97 
 
 
887 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.45 
 
 
904 aa  619  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  42.45 
 
 
895 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  43.39 
 
 
916 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  42.33 
 
 
895 aa  618  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  42.37 
 
 
918 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  42.71 
 
 
916 aa  615  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.49 
 
 
903 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  42.58 
 
 
900 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  42.91 
 
 
906 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  39.57 
 
 
897 aa  608  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2449  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  41.85 
 
 
869 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  43.34 
 
 
888 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  43.34 
 
 
893 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  41.73 
 
 
897 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.16 
 
 
884 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.16 
 
 
884 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.05 
 
 
884 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.34 
 
 
888 aa  602  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  43.4 
 
 
887 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.07 
 
 
888 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.05 
 
 
884 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  41.77 
 
 
898 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  41.85 
 
 
884 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  42.74 
 
 
886 aa  599  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  42.94 
 
 
902 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  42.23 
 
 
889 aa  592  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  41.09 
 
 
905 aa  589  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  40.84 
 
 
879 aa  592  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  42.92 
 
 
887 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.84 
 
 
879 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.61 
 
 
887 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  42.43 
 
 
887 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  43.08 
 
 
889 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  42.15 
 
 
893 aa  592  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  40.84 
 
 
879 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  41.94 
 
 
928 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  42.82 
 
 
889 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  42.14 
 
 
909 aa  589  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  42.82 
 
 
889 aa  588  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  42.82 
 
 
889 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  42.38 
 
 
885 aa  586  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  42.82 
 
 
889 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  42.82 
 
 
889 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  42.52 
 
 
897 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  42.05 
 
 
893 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  42.52 
 
 
897 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  43.27 
 
 
889 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.8 
 
 
906 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  42.04 
 
 
865 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  41.66 
 
 
882 aa  585  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  42.82 
 
 
898 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  41.8 
 
 
913 aa  581  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  44.38 
 
 
901 aa  580  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  41.06 
 
 
881 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  40.38 
 
 
899 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  41.42 
 
 
865 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  41.59 
 
 
889 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  40.39 
 
 
867 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.36 
 
 
891 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  41.73 
 
 
889 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  41.97 
 
 
889 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  42.09 
 
 
889 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  41.29 
 
 
880 aa  567  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  40.94 
 
 
880 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  41.4 
 
 
880 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  40.33 
 
 
910 aa  568  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  40.81 
 
 
878 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  44.52 
 
 
882 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  46.82 
 
 
866 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  40.96 
 
 
882 aa  565  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  39.84 
 
 
889 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  37.83 
 
 
868 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  41.68 
 
 
889 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  41.9 
 
 
889 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  41.12 
 
 
884 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  40.73 
 
 
882 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  44.31 
 
 
885 aa  561  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  42.35 
 
 
915 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  45.65 
 
 
877 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  37.81 
 
 
894 aa  555  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  38.16 
 
 
872 aa  551  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  40.23 
 
 
899 aa  549  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  44.47 
 
 
875 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  37.57 
 
 
873 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>