32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6514 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6514  TRAP-type uncharacterized transporter domain-containing protein  100 
 
 		 361 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0948459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7227  hypothetical protein  48.15 
 
 		 391 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.725548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0245  TRAP-type uncharacterized transporter domain-containing protein  43.36 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6523  TRAP-type uncharacterized transporter domain-containing protein  37.28 
 
 		 387 aa  242  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0064  hypothetical protein  37.28 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.257348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3808  hypothetical protein  36.47 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0224  hypothetical protein  36.47 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5709  hypothetical protein  36.87 
 
 		 381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5576  hypothetical protein  36.08 
 
 		 423 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3556  hypothetical protein  33.04 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.961167  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6916  hypothetical protein  31.28 
 
 		 420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2296  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  35.32 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1321  TRAP-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  31.6 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4032  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.95 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0151449  normal  0.772934 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3295  KDPG and KHG aldolase  27.67 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.808807 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3299  TRAP-T family transporter periplasmic binding component  26.6 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.783922  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1924  putative TRAP transporter solute receptor  25 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00617183  hitchhiker  0.0000000000275167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1781  hypothetical protein  24.09 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.568147  unclonable  0.000000000964145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4887  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  23.59 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0373897  normal  0.393187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3359  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.14 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  hitchhiker  0.000000000800909 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3559  TRAP-type uncharacterized transport system protein, periplasmic component  24.32 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0137  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  32.14 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0207  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  24.62 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.979925 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2159  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.7 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.239874  normal  0.13141 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0640  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  26.78 
 
 		 356 aa  46.2  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3566  TRAP transporter solute receptor, TAXI family protein  26.48 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.28304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2429  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.07 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6904  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.27 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1635  TAXI family TRAP transporter solute receptor  27.27 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0832335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  25.51 
 
 		 317 aa  43.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.745912 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1156  31 kDa immunogenic protein  30.08 
 
 		 316 aa  43.1  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>