More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3097 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3097  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1245  signal-transduction protein  47.59 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.09 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  34.92 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  40.16 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  35.71 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4959  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  36.09 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0978  CBS domain-containing protein  34.59 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  35.38 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0870  CBS domain containing protein  33.08 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.258061  normal  0.509671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  33.87 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1990  CBS domain containing protein  33.85 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1660  CBS domain containing protein  33.85 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0113728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  38.02 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  34.13 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  36.64 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1523  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  37.3 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  36.09 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  30.77 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  30.77 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.651384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  32.31 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  34.92 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  34.13 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  32.54 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.37 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  34.92 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  37.19 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3779  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1837  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0592619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.15 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  31.78 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  29.37 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2996  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1657  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1679  CBS domain containing protein  32.06 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2047  CBS domain containing protein  32.56 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  30.95 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  31.75 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  35.71 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  31.45 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1254  CBS  31.01 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  32.61 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  31.78 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1087  signal-transduction protein  35.66 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0884607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3616  signal-transduction protein  31.75 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  30.16 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  32.54 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  34.43 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  31.75 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  33.88 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  27.94 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  31.78 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3498  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.54 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156756  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  33.87 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  29.23 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  33.9 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1563  hypothetical protein  31.58 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1423  hypothetical protein  31.01 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.13 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  32.06 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  35.66 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3078  CBS domain containing protein  32.56 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  35.94 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1791  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  34.35 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0254  signal-transduction protein  35.78 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00659332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  34.4 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  33.66 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  29.46 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4603  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  33.81 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1436  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0976  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1339  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1379  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.925152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1458  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.867241  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  31.97 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  30.58 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1135  signal-transduction protein  31.54 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>