More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0866 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0866  NusB/RsmB/TIM44  100 
 
 		 463 aa  953    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000084773  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1711  NusB/RsmB/TIM44  30.33 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09910  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  30.83 
 
 		 531 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000618646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  28.84 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  27.09 
 
 		 440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  25.47 
 
 		 446 aa  124  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  25.21 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  26.07 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  27.34 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  29.74 
 
 		 452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  26 
 
 		 455 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  27.87 
 
 		 484 aa  118  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  26.22 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  25.99 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  28.65 
 
 		 439 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  25.99 
 
 		 451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  25.73 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  25.22 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  23.96 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.29 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1498  NusB/RsmB/TIM44  27.49 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.791703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  25.32 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  27.9 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  29.32 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  25.78 
 
 		 448 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.99 
 
 		 509 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  29.6 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  26.76 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  27.15 
 
 		 448 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  24.2 
 
 		 435 aa  110  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  26.64 
 
 		 453 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  25.24 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  28.79 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  25.84 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  27.46 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  25.51 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  26.18 
 
 		 450 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2843  sun protein  27.27 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.48 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  26.47 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  24.63 
 
 		 443 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  25.52 
 
 		 424 aa  107  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  27.44 
 
 		 450 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  25.72 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  27.27 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  26.43 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  26.35 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  23.99 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  24.42 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  25.16 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  28.92 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.97 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  25.12 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  28.7 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  27.38 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  26.7 
 
 		 450 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  24.41 
 
 		 435 aa  104  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  24.41 
 
 		 435 aa  104  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  25.58 
 
 		 452 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  28.07 
 
 		 455 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  26.19 
 
 		 444 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  26.2 
 
 		 444 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  26.2 
 
 		 444 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  26.2 
 
 		 444 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  26.2 
 
 		 444 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.83 
 
 		 472 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  28.34 
 
 		 447 aa  103  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  27.66 
 
 		 437 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  26.7 
 
 		 465 aa  103  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  25.97 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  25.63 
 
 		 444 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  25.31 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  25.19 
 
 		 468 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  26.43 
 
 		 444 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  26.7 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07960  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  32.58 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.29477 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  26.24 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  26.52 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  26.13 
 
 		 464 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  24.64 
 
 		 446 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  27.32 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  26.99 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  22.6 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  26.03 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  25.77 
 
 		 444 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  26.7 
 
 		 447 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  26.03 
 
 		 438 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  25.31 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  25.24 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  30.51 
 
 		 454 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  26.41 
 
 		 456 aa  98.2  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  22.37 
 
 		 442 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  24.78 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  23.09 
 
 		 452 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  26.55 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  28.46 
 
 		 466 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  29.19 
 
 		 527 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000139928 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  28.91 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2215  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.47 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  25.41 
 
 		 438 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>