More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3970 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  94.29 
 
 		 455 aa  717    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  100 
 
 		 455 aa  854    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  94.07 
 
 		 455 aa  716    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  78.49 
 
 		 439 aa  601  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  43.08 
 
 		 451 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  37 
 
 		 448 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  42.06 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  39.87 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  36.26 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  39.47 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  33.99 
 
 		 452 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  39.61 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  38.41 
 
 		 449 aa  240  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  35.84 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  35.62 
 
 		 448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  36.54 
 
 		 452 aa  229  8e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  30.33 
 
 		 449 aa  229  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  34.29 
 
 		 453 aa  229  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  35.82 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  35.41 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  36.62 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  40 
 
 		 501 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  38.83 
 
 		 451 aa  217  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  36.03 
 
 		 451 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  28.16 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  29.16 
 
 		 455 aa  213  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  38.68 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  32.46 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  31.54 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  30.58 
 
 		 442 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.94 
 
 		 442 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  32.02 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  30.13 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  31.5 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  35.89 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  31.73 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  31.5 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  32.09 
 
 		 444 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  32.09 
 
 		 444 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  32.09 
 
 		 444 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  32.09 
 
 		 444 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  32.31 
 
 		 444 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  32.09 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  31.86 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  36.49 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  28.54 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  32.09 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  26.34 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  26.34 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  31.6 
 
 		 447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.26 
 
 		 449 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  36.52 
 
 		 432 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  28.86 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.52 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.51 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.16 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  42.16 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  36.62 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  27.67 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  30.53 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.17 
 
 		 509 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  39.6 
 
 		 484 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30.97 
 
 		 438 aa  182  8.000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.96 
 
 		 495 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  32.74 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  30.3 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  38.16 
 
 		 517 aa  180  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  33.11 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  39.79 
 
 		 494 aa  179  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  29.96 
 
 		 456 aa  178  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  33.04 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  29.66 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.92 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  29.67 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.35 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  37.21 
 
 		 505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  40.58 
 
 		 509 aa  173  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  30.04 
 
 		 432 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  27.87 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0317  sun protein  28.73 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.73 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.46 
 
 		 438 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  32.44 
 
 		 445 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  36.72 
 
 		 471 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.21 
 
 		 445 aa  170  6e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  30.92 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  42.16 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  38.71 
 
 		 489 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.36 
 
 		 472 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  35.52 
 
 		 450 aa  166  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  27.33 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  27.78 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  27.55 
 
 		 438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  31.16 
 
 		 471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  38.34 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  37.29 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  40.3 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  38.64 
 
 		 438 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  39.65 
 
 		 460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  36.9 
 
 		 476 aa  163  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>