More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1076 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  100 
 
 		 476 aa  938    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  73.13 
 
 		 489 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  62.5 
 
 		 471 aa  497  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  59.87 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  59.75 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  55.15 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  54.94 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  52.53 
 
 		 484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  53.99 
 
 		 505 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  56.19 
 
 		 478 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.56 
 
 		 449 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.37 
 
 		 455 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  52.33 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.37 
 
 		 455 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  51.16 
 
 		 551 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  52.37 
 
 		 455 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.58 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  55.85 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.96 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  49.9 
 
 		 527 aa  372  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000139928 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  50.65 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.92 
 
 		 539 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  54.39 
 
 		 509 aa  364  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  48.8 
 
 		 452 aa  362  6e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.63 
 
 		 440 aa  362  9e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  52.77 
 
 		 517 aa  359  5e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  50.21 
 
 		 486 aa  353  4e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.03 
 
 		 495 aa  349  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  48.69 
 
 		 517 aa  344  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  51.23 
 
 		 508 aa  344  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  51.78 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  53.2 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  48.81 
 
 		 502 aa  330  3e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  49.29 
 
 		 491 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  47.77 
 
 		 543 aa  322  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2576  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.36 
 
 		 532 aa  303  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263065  normal  0.0210244 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  37.83 
 
 		 446 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  34.83 
 
 		 448 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  36.17 
 
 		 448 aa  229  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  37.26 
 
 		 457 aa  227  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  36.85 
 
 		 452 aa  220  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  31.68 
 
 		 449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  30.39 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  35.62 
 
 		 453 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  29.26 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  32.97 
 
 		 452 aa  213  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  33.55 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  33.55 
 
 		 448 aa  212  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  34.28 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  36.36 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.82 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  34.25 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  34.13 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  35.06 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  31.82 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  30.95 
 
 		 446 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  29.72 
 
 		 462 aa  196  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  29.4 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  30.89 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  29.7 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  30.33 
 
 		 456 aa  190  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  29.17 
 
 		 451 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  29.17 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  26.7 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  26.91 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  26.91 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  32.4 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  31.25 
 
 		 444 aa  183  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  34.66 
 
 		 501 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  35.87 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  31.25 
 
 		 444 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  33.69 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  29.65 
 
 		 449 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  31.17 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  30.43 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  30.74 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  32.61 
 
 		 444 aa  177  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  30.89 
 
 		 444 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  30.6 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  26.83 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  30.6 
 
 		 444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  30.6 
 
 		 444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  30.6 
 
 		 444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  30.6 
 
 		 444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  26.53 
 
 		 442 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  29.93 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  35.86 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  32.84 
 
 		 432 aa  170  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  37.61 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  36.99 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  31.81 
 
 		 447 aa  163  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  31 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  27.25 
 
 		 438 aa  162  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  30.82 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29 
 
 		 438 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0591  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.31 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0728  sun protein  30.75 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  33.03 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  29.69 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  35.6 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>