More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3368 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3450  signal recognition particle protein  89.44 
 
 
550 aa  971    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.279897  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3368  signal recognition particle protein  100 
 
 
550 aa  1091    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3307  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  89.63 
 
 
550 aa  972    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3386  signal recognition particle protein  89.63 
 
 
550 aa  972    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3451  signal recognition particle protein  57.41 
 
 
568 aa  538  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0611736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  49.67 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  48.74 
 
 
433 aa  392  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  48.05 
 
 
433 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  48.74 
 
 
448 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0181  signal recognition particle protein  46.92 
 
 
491 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  46.59 
 
 
443 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  48.87 
 
 
444 aa  380  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  48.42 
 
 
444 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  47.25 
 
 
446 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  46.67 
 
 
453 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  45.77 
 
 
455 aa  375  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.82 
 
 
446 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  47.38 
 
 
450 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.17 
 
 
447 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.73 
 
 
447 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  47.59 
 
 
449 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  47.06 
 
 
446 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  47.67 
 
 
445 aa  368  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  46.96 
 
 
446 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  45.08 
 
 
455 aa  369  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  44.44 
 
 
443 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  45.08 
 
 
455 aa  369  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.88 
 
 
512 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.41 
 
 
443 aa  365  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  47.03 
 
 
444 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  42.92 
 
 
439 aa  365  2e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  46.4 
 
 
469 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  43.37 
 
 
479 aa  362  7.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  45.52 
 
 
446 aa  361  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  48.62 
 
 
452 aa  361  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  43.3 
 
 
476 aa  359  6e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  44.54 
 
 
449 aa  359  7e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2225  signal recognition particle protein  43.86 
 
 
451 aa  359  7e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000252662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  45.87 
 
 
449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  45.87 
 
 
449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  45.87 
 
 
449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  45.87 
 
 
449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  44.2 
 
 
439 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  43.68 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  46.1 
 
 
449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  45.87 
 
 
449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  46.59 
 
 
449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  45.64 
 
 
449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45 
 
 
454 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  45.64 
 
 
449 aa  356  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  45.64 
 
 
449 aa  356  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  46.93 
 
 
458 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  46.93 
 
 
458 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  45.64 
 
 
449 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  45.64 
 
 
449 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  44.96 
 
 
448 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1304  signal recognition particle protein  45.54 
 
 
445 aa  355  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000911633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1147  signal recognition particle protein  46.19 
 
 
521 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0335878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  47.51 
 
 
453 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  46.44 
 
 
512 aa  352  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  45.49 
 
 
450 aa  352  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  44.29 
 
 
440 aa  352  8e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.53 
 
 
443 aa  352  1e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  47.29 
 
 
453 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1327  signal recognition particle protein  46.21 
 
 
441 aa  350  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  43.84 
 
 
459 aa  350  3e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  46.14 
 
 
453 aa  351  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.25 
 
 
481 aa  349  6e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  44.15 
 
 
518 aa  350  6e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  44.42 
 
 
444 aa  349  6e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1788  signal recognition particle protein  44.96 
 
 
442 aa  349  7e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1376  signal recognition particle protein  44.73 
 
 
472 aa  349  8e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010418  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1967  signal recognition particle protein  43.51 
 
 
452 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000299479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1685  signal recognition particle protein  43.51 
 
 
452 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000161061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0503  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.87 
 
 
462 aa  347  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  44.04 
 
 
451 aa  347  4e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  43.39 
 
 
443 aa  347  4e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  43.12 
 
 
449 aa  346  5e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  45.03 
 
 
493 aa  346  6e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  44.06 
 
 
449 aa  346  7e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.61 
 
 
452 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3683  signal recognition particle protein  43.96 
 
 
444 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  43.58 
 
 
449 aa  345  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  44 
 
 
492 aa  345  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  44.83 
 
 
449 aa  345  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  43.78 
 
 
522 aa  345  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  40.85 
 
 
521 aa  344  2.9999999999999997e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  45.35 
 
 
456 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  44.37 
 
 
434 aa  343  5e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  43.87 
 
 
435 aa  343  5e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  45.24 
 
 
454 aa  343  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  45.24 
 
 
454 aa  343  5e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  44.83 
 
 
449 aa  343  5.999999999999999e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.08 
 
 
470 aa  342  9e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  40.04 
 
 
520 aa  342  9e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  42.11 
 
 
517 aa  342  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39979  IISP family transporter: signal recognition particle protein (SRP54)  44.98 
 
 
498 aa  341  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.86 
 
 
515 aa  341  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.16 
 
 
491 aa  341  2e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  43.45 
 
 
449 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>