More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0407 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0407  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
252 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0667813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34670  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  63.92 
 
 
225 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5993  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  60.33 
 
 
218 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.554232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3030  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  58.7 
 
 
226 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0235882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1046  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.96 
 
 
218 aa  244  9e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3114  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.05 
 
 
226 aa  241  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.64 
 
 
212 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4886  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.06 
 
 
221 aa  234  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0534  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.63 
 
 
226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10419  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.06 
 
 
222 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553415  normal  0.826852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0198  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.37 
 
 
237 aa  224  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0544  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.22 
 
 
226 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.229727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0556  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.22 
 
 
226 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655904  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  58.06 
 
 
221 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2786  Thiamine-phosphate diphosphorylase  58.75 
 
 
213 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3749  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.05 
 
 
222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1343  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.84 
 
 
221 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  hitchhiker  0.000481563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1455  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.45 
 
 
222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.42 
 
 
221 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.36 
 
 
237 aa  191  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404805  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2503  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.06 
 
 
240 aa  182  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000857032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0496  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.78 
 
 
220 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07950  thiamine-phosphate diphosphorylase  46.64 
 
 
247 aa  176  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0172008  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3070  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.04 
 
 
237 aa  175  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.2 
 
 
229 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0770  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.44 
 
 
227 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.090821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.89 
 
 
360 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.3 
 
 
343 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.3 
 
 
343 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.35 
 
 
208 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.1 
 
 
208 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0711  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.31 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.78 
 
 
347 aa  145  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.74 
 
 
368 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.3 
 
 
343 aa  143  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.08 
 
 
379 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.24 
 
 
353 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.33 
 
 
350 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.33 
 
 
350 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.89 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.13 
 
 
352 aa  125  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.98 
 
 
346 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1923  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.29 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.425908  normal  0.352595 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.34 
 
 
346 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.7 
 
 
344 aa  115  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  34.65 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.19 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.06 
 
 
220 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.23 
 
 
365 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.61 
 
 
214 aa  108  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.56 
 
 
211 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.2 
 
 
353 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.94 
 
 
351 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.16 
 
 
221 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  37.07 
 
 
208 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.34 
 
 
218 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.06 
 
 
351 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.78 
 
 
218 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.48 
 
 
218 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
536 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.19 
 
 
219 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.02 
 
 
220 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.56 
 
 
211 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.27 
 
 
216 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  34.25 
 
 
217 aa  100  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.06 
 
 
214 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.65 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.82 
 
 
356 aa  99.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  32.05 
 
 
209 aa  99.4  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  34.74 
 
 
210 aa  98.6  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.94 
 
 
212 aa  98.6  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.75 
 
 
206 aa  98.6  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.1 
 
 
209 aa  98.6  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.63 
 
 
352 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  34.48 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  34.5 
 
 
497 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0276  hypothetical protein  34.1 
 
 
212 aa  98.2  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.6 
 
 
202 aa  98.2  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.41 
 
 
208 aa  97.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.99 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.81 
 
 
211 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.07 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.31 
 
 
216 aa  95.9  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.26 
 
 
204 aa  95.9  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.17 
 
 
207 aa  95.9  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.07 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.1 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.57 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.57 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.65 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.19 
 
 
223 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.76 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.14 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.19 
 
 
203 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.14 
 
 
210 aa  92.8  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.78 
 
 
236 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.75 
 
 
219 aa  91.7  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.3 
 
 
211 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.35 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>