More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10419 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10419  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
222 aa  434  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553415  normal  0.826852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0534  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  76.28 
 
 
226 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  73.99 
 
 
221 aa  289  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0198  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  75.46 
 
 
237 aa  287  8e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0544  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  76.74 
 
 
226 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.229727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0556  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  76.74 
 
 
226 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655904  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34670  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  62.84 
 
 
225 aa  250  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5993  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  60.27 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.554232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3114  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  65.05 
 
 
226 aa  238  8e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1046  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  63.01 
 
 
218 aa  234  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  67.14 
 
 
221 aa  232  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3749  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  66.83 
 
 
222 aa  228  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0407  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.02 
 
 
252 aa  228  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0667813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  60.5 
 
 
212 aa  227  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3030  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.32 
 
 
226 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0235882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4886  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  58.49 
 
 
221 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2786  Thiamine-phosphate diphosphorylase  59.91 
 
 
213 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2503  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.92 
 
 
240 aa  205  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000857032 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1455  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  58.69 
 
 
222 aa  204  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1343  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  60 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  hitchhiker  0.000481563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.71 
 
 
237 aa  198  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0496  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.12 
 
 
220 aa  191  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07950  thiamine-phosphate diphosphorylase  50.88 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0172008  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.01 
 
 
379 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0770  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.77 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.090821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3070  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.75 
 
 
237 aa  165  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.93 
 
 
368 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.67 
 
 
343 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.98 
 
 
347 aa  162  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.67 
 
 
343 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.13 
 
 
229 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.71 
 
 
343 aa  158  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.74 
 
 
360 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.55 
 
 
346 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0711  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.11 
 
 
231 aa  154  7e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.2 
 
 
208 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.79 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.94 
 
 
353 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.5 
 
 
208 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.91 
 
 
214 aa  135  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1923  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.47 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.425908  normal  0.352595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  39.05 
 
 
213 aa  128  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.74 
 
 
350 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.74 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.79 
 
 
343 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.31 
 
 
346 aa  124  9e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.28 
 
 
221 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.27 
 
 
350 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.5 
 
 
352 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.25 
 
 
211 aa  122  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.76 
 
 
220 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.41 
 
 
365 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.15 
 
 
252 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.81 
 
 
211 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.18 
 
 
219 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.56 
 
 
352 aa  118  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.21 
 
 
536 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.08 
 
 
353 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.49 
 
 
208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.16 
 
 
218 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.43 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.73 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.31 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.94 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  34.27 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  36.57 
 
 
210 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.02 
 
 
352 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.31 
 
 
207 aa  111  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.64 
 
 
202 aa  111  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  40.19 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.11 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.68 
 
 
352 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000736904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.67 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.57 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.29 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.1 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.87 
 
 
222 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.38 
 
 
344 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.45 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.81 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.56 
 
 
218 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.62 
 
 
236 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.5 
 
 
217 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.59 
 
 
216 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.67 
 
 
351 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.49 
 
 
207 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.47 
 
 
210 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.77 
 
 
351 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  36.46 
 
 
217 aa  105  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.49 
 
 
207 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  35.44 
 
 
209 aa  105  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.2 
 
 
211 aa  105  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.27 
 
 
206 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  36.19 
 
 
492 aa  104  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.71 
 
 
211 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.53 
 
 
223 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.79 
 
 
206 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.06 
 
 
207 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>