More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4391 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
221 aa  431  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0534  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  71.23 
 
 
226 aa  278  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  72.51 
 
 
221 aa  271  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0544  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  70.28 
 
 
226 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.229727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0556  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  70.28 
 
 
226 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655904  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0198  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  71.29 
 
 
237 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10419  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  69.01 
 
 
222 aa  256  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553415  normal  0.826852 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3749  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  69.12 
 
 
222 aa  254  8e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34670  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  62.62 
 
 
225 aa  239  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3030  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.72 
 
 
226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0235882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1046  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.07 
 
 
218 aa  225  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1455  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  62.68 
 
 
222 aa  223  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3114  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  58.17 
 
 
226 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0407  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  52.82 
 
 
252 aa  212  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0667813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.65 
 
 
212 aa  210  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5993  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.3 
 
 
218 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.554232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4886  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.04 
 
 
221 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0496  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.35 
 
 
220 aa  201  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2503  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.45 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000857032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.59 
 
 
237 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404805  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1343  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.35 
 
 
221 aa  192  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  hitchhiker  0.000481563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2786  Thiamine-phosphate diphosphorylase  53.52 
 
 
213 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3070  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50 
 
 
237 aa  184  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50 
 
 
229 aa  168  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0770  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.85 
 
 
227 aa  167  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.090821 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07950  thiamine-phosphate diphosphorylase  47.77 
 
 
247 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0172008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.4 
 
 
343 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.99 
 
 
379 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.4 
 
 
343 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1923  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.67 
 
 
221 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.425908  normal  0.352595 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.19 
 
 
360 aa  144  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.45 
 
 
208 aa  142  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.98 
 
 
208 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.01 
 
 
368 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.25 
 
 
347 aa  141  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.65 
 
 
346 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.54 
 
 
343 aa  134  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.67 
 
 
208 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0711  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.99 
 
 
231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.09 
 
 
353 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.46 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.41 
 
 
343 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.58 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.58 
 
 
212 aa  116  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.04 
 
 
252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  39.02 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.64 
 
 
350 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
212 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.64 
 
 
350 aa  111  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.16 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.63 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.18 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.58 
 
 
211 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.38 
 
 
214 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.63 
 
 
211 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.35 
 
 
216 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.74 
 
 
344 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.89 
 
 
218 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.19 
 
 
221 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.72 
 
 
208 aa  106  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.15 
 
 
536 aa  105  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.49 
 
 
207 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.73 
 
 
346 aa  105  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.02 
 
 
365 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.94 
 
 
215 aa  105  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.89 
 
 
219 aa  104  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.32 
 
 
236 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  31.6 
 
 
204 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.01 
 
 
207 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.02 
 
 
206 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
207 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.08 
 
 
217 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.26 
 
 
215 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 
206 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.95 
 
 
204 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.8 
 
 
356 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  36.84 
 
 
209 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.62 
 
 
216 aa  101  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3007  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.48 
 
 
213 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.06 
 
 
206 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.07 
 
 
211 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  38.86 
 
 
208 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  35.27 
 
 
210 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.35 
 
 
353 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.69 
 
 
218 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  39.32 
 
 
497 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.16 
 
 
228 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3286  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.96 
 
 
211 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.17 
 
 
210 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.44 
 
 
218 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.1 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.86 
 
 
214 aa  99  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.91 
 
 
209 aa  98.6  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.97 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  38.05 
 
 
490 aa  98.6  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.7 
 
 
351 aa  98.2  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.56 
 
 
223 aa  98.2  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.73 
 
 
208 aa  98.2  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.13 
 
 
213 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>