More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2503 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2503  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
240 aa  470  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000857032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  67.91 
 
 
237 aa  263  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404805  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1046  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.81 
 
 
218 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5993  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.62 
 
 
218 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.554232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1455  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  60.49 
 
 
222 aa  228  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34670  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.28 
 
 
225 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3030  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.66 
 
 
226 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0235882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.51 
 
 
212 aa  218  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4886  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55 
 
 
221 aa  218  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3114  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.11 
 
 
226 aa  217  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10419  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.92 
 
 
222 aa  217  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553415  normal  0.826852 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0534  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.08 
 
 
226 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0198  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.95 
 
 
237 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.66 
 
 
221 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0544  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.08 
 
 
226 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.229727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0556  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.08 
 
 
226 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655904  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0496  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.5 
 
 
220 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.88 
 
 
221 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2786  Thiamine-phosphate diphosphorylase  53.52 
 
 
213 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0407  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.24 
 
 
252 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0667813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1343  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.19 
 
 
221 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  hitchhiker  0.000481563 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07950  thiamine-phosphate diphosphorylase  52.02 
 
 
247 aa  189  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0172008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3749  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.94 
 
 
222 aa  188  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0770  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.91 
 
 
227 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.090821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3070  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.73 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.44 
 
 
229 aa  161  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.15 
 
 
347 aa  159  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.15 
 
 
368 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.67 
 
 
343 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.41 
 
 
343 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.68 
 
 
360 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.93 
 
 
208 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.19 
 
 
343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.89 
 
 
208 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.67 
 
 
379 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1923  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.26 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.425908  normal  0.352595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
346 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.36 
 
 
208 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0711  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.5 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.34 
 
 
353 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.15 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.29 
 
 
217 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.45 
 
 
208 aa  122  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.58 
 
 
214 aa  122  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.23 
 
 
216 aa  118  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.29 
 
 
356 aa  118  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.31 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.54 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.18 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.98 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  35.92 
 
 
213 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.49 
 
 
350 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.86 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.98 
 
 
346 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.38 
 
 
365 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.86 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1139  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.56 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.123471 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.33 
 
 
353 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.63 
 
 
343 aa  111  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.35 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.42 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.8 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.19 
 
 
352 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.06 
 
 
351 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.98 
 
 
206 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.14 
 
 
212 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.31 
 
 
352 aa  106  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.87 
 
 
215 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.33 
 
 
221 aa  105  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.1 
 
 
351 aa  105  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.24 
 
 
215 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.86 
 
 
211 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  35.19 
 
 
210 aa  104  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  35.29 
 
 
209 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.63 
 
 
219 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
222 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 
204 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.45 
 
 
352 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.07 
 
 
224 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.57 
 
 
211 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.82 
 
 
536 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6680  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.28 
 
 
211 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  0.587855 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.67 
 
 
209 aa  102  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.47 
 
 
236 aa  101  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.15 
 
 
218 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
221 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.27 
 
 
344 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31 
 
 
223 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  32.86 
 
 
204 aa  99.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.83 
 
 
352 aa  98.6  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000736904  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  36.27 
 
 
208 aa  98.6  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.42 
 
 
223 aa  98.2  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.9 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.18 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4837  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.94 
 
 
207 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.8 
 
 
206 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.24 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.93 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4946  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.9 
 
 
207 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>