More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4886 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4886  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
221 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3030  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  66.83 
 
 
226 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0235882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5993  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  63.01 
 
 
218 aa  258  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.554232 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  64.4 
 
 
212 aa  239  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0407  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.04 
 
 
252 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0667813  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1046  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  62.86 
 
 
218 aa  228  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34670  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  60.37 
 
 
225 aa  227  9e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0534  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.93 
 
 
226 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2786  Thiamine-phosphate diphosphorylase  64.29 
 
 
213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3114  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.9 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1343  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  65.35 
 
 
221 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  hitchhiker  0.000481563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0544  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.01 
 
 
226 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.229727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0556  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.01 
 
 
226 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655904  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1455  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.75 
 
 
222 aa  214  8e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0198  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.19 
 
 
237 aa  211  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10419  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  58.8 
 
 
222 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553415  normal  0.826852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.72 
 
 
221 aa  204  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2503  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.85 
 
 
240 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000857032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.17 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404805  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3749  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  58.21 
 
 
222 aa  190  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.72 
 
 
221 aa  182  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0496  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.27 
 
 
220 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3070  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50 
 
 
237 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0770  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.74 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.090821 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07950  thiamine-phosphate diphosphorylase  47.32 
 
 
247 aa  164  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0172008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  54.55 
 
 
229 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41 
 
 
379 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.24 
 
 
343 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0711  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.7 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.18 
 
 
368 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.46 
 
 
347 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.56 
 
 
343 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.56 
 
 
343 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.87 
 
 
353 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.41 
 
 
360 aa  125  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1923  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.83 
 
 
221 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.425908  normal  0.352595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.78 
 
 
208 aa  121  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.43 
 
 
352 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.5 
 
 
346 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.98 
 
 
350 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.47 
 
 
350 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.21 
 
 
208 aa  111  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.89 
 
 
211 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.56 
 
 
344 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.61 
 
 
214 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.22 
 
 
216 aa  105  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.57 
 
 
343 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.01 
 
 
346 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.95 
 
 
356 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  39.09 
 
 
213 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.58 
 
 
365 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.68 
 
 
220 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.19 
 
 
206 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.21 
 
 
214 aa  100  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  40.5 
 
 
209 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.03 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.2 
 
 
205 aa  99  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2103  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.7 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.7 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  39.11 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.59 
 
 
351 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.78 
 
 
536 aa  96.7  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.64 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.35 
 
 
353 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0076  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.15 
 
 
215 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0077197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  39.2 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.71 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.45 
 
 
351 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.16 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.07 
 
 
236 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.12 
 
 
216 aa  92.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.44 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.18 
 
 
217 aa  91.7  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0276  hypothetical protein  36.97 
 
 
212 aa  91.7  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.43 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  39.2 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.88 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.54 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4659  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.79 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.88 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.65 
 
 
352 aa  89.4  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.79 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655377  normal  0.0379586 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.52 
 
 
212 aa  89  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.25 
 
 
219 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.91 
 
 
215 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.89 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.59 
 
 
234 aa  87.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.76 
 
 
213 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.88 
 
 
206 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.18 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.63 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.98 
 
 
210 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4837  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.85 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.65 
 
 
206 aa  85.9  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1139  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.02 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.123471 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1099  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.18 
 
 
210 aa  85.5  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.238552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>