More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3749 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3749  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
222 aa  431  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  70.7 
 
 
221 aa  266  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0534  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  69.01 
 
 
226 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  69.23 
 
 
221 aa  264  5.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0544  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  69.48 
 
 
226 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.229727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0556  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  69.48 
 
 
226 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655904  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0198  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  69.86 
 
 
237 aa  258  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34670  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  66.36 
 
 
225 aa  258  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10419  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  65.28 
 
 
222 aa  252  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553415  normal  0.826852 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0407  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  58 
 
 
252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0667813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3030  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  60.81 
 
 
226 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0235882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.73 
 
 
212 aa  231  6e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1046  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.03 
 
 
218 aa  228  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5993  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.01 
 
 
218 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.554232 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3114  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.9 
 
 
226 aa  219  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2786  Thiamine-phosphate diphosphorylase  58.88 
 
 
213 aa  218  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1455  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.16 
 
 
222 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4886  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  58.25 
 
 
221 aa  208  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1343  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.9 
 
 
221 aa  208  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  hitchhiker  0.000481563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0496  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.94 
 
 
220 aa  207  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2503  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.94 
 
 
240 aa  197  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000857032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  53.57 
 
 
237 aa  188  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404805  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07950  thiamine-phosphate diphosphorylase  50.22 
 
 
247 aa  178  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0172008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0770  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50 
 
 
227 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.090821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.67 
 
 
343 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.67 
 
 
343 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3070  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.44 
 
 
237 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.96 
 
 
208 aa  149  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.19 
 
 
379 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.78 
 
 
346 aa  144  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1923  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.23 
 
 
221 aa  144  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.425908  normal  0.352595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
347 aa  141  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.72 
 
 
208 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.52 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.79 
 
 
368 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.16 
 
 
229 aa  135  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0711  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.52 
 
 
231 aa  132  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.69 
 
 
343 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.04 
 
 
360 aa  131  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.37 
 
 
353 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  40.78 
 
 
213 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.23 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.81 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.66 
 
 
252 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.94 
 
 
350 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.48 
 
 
350 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.62 
 
 
352 aa  119  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  40.1 
 
 
209 aa  119  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.73 
 
 
536 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.49 
 
 
344 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  40.74 
 
 
208 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.74 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.01 
 
 
215 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.91 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.13 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
346 aa  112  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.5 
 
 
206 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.11 
 
 
214 aa  112  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.81 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.32 
 
 
223 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.77 
 
 
365 aa  111  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.91 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.81 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.26 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.71 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.1 
 
 
218 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  36.23 
 
 
210 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.25 
 
 
221 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.25 
 
 
202 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.96 
 
 
343 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.3 
 
 
206 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
217 aa  105  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.31 
 
 
352 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.81 
 
 
211 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  38.66 
 
 
212 aa  105  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.49 
 
 
214 aa  104  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.86 
 
 
208 aa  105  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.65 
 
 
356 aa  104  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.79 
 
 
219 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.48 
 
 
213 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.42 
 
 
206 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.05 
 
 
211 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.47 
 
 
234 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.65 
 
 
228 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.81 
 
 
203 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.74 
 
 
223 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.47 
 
 
216 aa  101  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  33.8 
 
 
204 aa  101  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  37.44 
 
 
217 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.87 
 
 
218 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.13 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.65 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.72 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  37.26 
 
 
492 aa  99.4  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.55 
 
 
207 aa  99.4  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.26 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.05 
 
 
214 aa  99  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0797  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.42 
 
 
217 aa  99  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.961406 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.84 
 
 
212 aa  98.6  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.71 
 
 
206 aa  98.6  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>