34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3815 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  100 
 
 
211 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  41.24 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  37.5 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  30.77 
 
 
196 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  31.47 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  30.96 
 
 
196 aa  84.7  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  31.58 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  35.44 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  32.34 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  34.5 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  36.99 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  30.88 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  33.11 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  35.46 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  29.58 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  26.32 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  29.38 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  41.09 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  32.17 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  31.25 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  32.59 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.86 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0387561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  30.99 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2592  hypothetical protein  36.15 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.116352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26780  hypothetical protein  34.76 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.576099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04400  hypothetical protein  24.73 
 
 
193 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4216  hypothetical protein  31.03 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.559313  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3584  hypothetical protein  31.61 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3178  hypothetical protein  26.53 
 
 
228 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.82146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  30.53 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0919  hypothetical protein  35.09 
 
 
194 aa  45.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000270991  unclonable  1.59322e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0688  hypothetical protein  25.54 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  30 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0630  hypothetical protein  32.14 
 
 
204 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313929  normal  0.063756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>