28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4180 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  401  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  34.22 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  41.24 
 
 		 211 aa  94.7  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  36.18 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  33.7 
 
 		 196 aa  89  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  31.28 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  28.79 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  30.94 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  33.15 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  33.09 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  31.58 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  28.43 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  30.28 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  26.52 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  33.81 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  29.87 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  30.77 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  27.42 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  28.79 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  31.58 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  29.55 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3584  hypothetical protein  33.88 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  30.4 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.05 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0387561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  28.11 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0688  hypothetical protein  33.04 
 
 		 232 aa  45.1  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0919  hypothetical protein  29.57 
 
 		 194 aa  42  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000270991  unclonable  1.59322e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>