27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1001 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  39.77 
 
 		 208 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  38.58 
 
 		 197 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  35.12 
 
 		 202 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  37.28 
 
 		 204 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  35.17 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  34.27 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  29.61 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26780  hypothetical protein  34.78 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.576099 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  24.14 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  31.78 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  29.92 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  37.07 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  24.64 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  25.12 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  26.09 
 
 		 197 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  25.36 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  25.48 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  23.67 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  24.14 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  24.85 
 
 		 199 aa  52.4  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  24.26 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0919  hypothetical protein  19.65 
 
 		 194 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000270991  unclonable  1.59322e-23 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  34.58 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.61 
 
 		 199 aa  49.3  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0387561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3584  hypothetical protein  28.5 
 
 		 193 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04400  hypothetical protein  25.19 
 
 		 193 aa  45.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>