18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4272 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3584  hypothetical protein  81.35 
 
 		 193 aa  275  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  42.36 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  27.87 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  27.87 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  29.69 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  30.18 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  32.1 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  31.58 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  32.97 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  29.21 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  30.17 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  28.07 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  31.25 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  27.42 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  29.65 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  27.69 
 
 		 197 aa  42  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  36.07 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>