31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8933 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  44 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  39.23 
 
 
204 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  37.16 
 
 
202 aa  104  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  38.58 
 
 
267 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  36.67 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  37.35 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  36.99 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  31.58 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26780  hypothetical protein  38.33 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.576099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  30.82 
 
 
197 aa  79  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  31.05 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  31.05 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  33.33 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  31.97 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  31.29 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  31.43 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  30.26 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  30.65 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  30.61 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  32.41 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  26.2 
 
 
304 aa  68.6  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.02 
 
 
199 aa  62  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0387561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3584  hypothetical protein  31.82 
 
 
193 aa  61.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  35.08 
 
 
211 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  33.1 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0919  hypothetical protein  26.11 
 
 
194 aa  52  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000270991  unclonable  1.59322e-23 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  32.5 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0688  hypothetical protein  29.63 
 
 
232 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04400  hypothetical protein  24.85 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4216  hypothetical protein  30.48 
 
 
234 aa  41.6  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.559313  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>