29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0838 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  388  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  80.31 
 
 
194 aa  311  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  71.07 
 
 
197 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  70.56 
 
 
197 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  72.68 
 
 
199 aa  274  5e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  68.53 
 
 
197 aa  269  2e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  61.93 
 
 
197 aa  210  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  28.26 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  28.12 
 
 
304 aa  78.6  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  31.76 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  28.4 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  29.35 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  27.32 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  26.09 
 
 
267 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0387561  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  29.79 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  28.57 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  29.08 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  31.06 
 
 
211 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  27.66 
 
 
187 aa  51.6  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3178  hypothetical protein  32.5 
 
 
228 aa  51.2  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.82146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26780  hypothetical protein  30.08 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.576099 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  31.15 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  28.26 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  26.77 
 
 
213 aa  48.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  25.62 
 
 
204 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2592  hypothetical protein  27.07 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.116352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0630  hypothetical protein  26.99 
 
 
204 aa  42.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313929  normal  0.063756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>