29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26780  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  377  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.576099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  52.46 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  41.94 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  38.89 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  40 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  42.01 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  34.78 
 
 		 267 aa  89  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.78 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0387561  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  29.33 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  29.73 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  27.52 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  27.22 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  33.55 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  30.85 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  26.67 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  30.66 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  29.5 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  27.21 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  25.14 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  32.24 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  32.28 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  28 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  32.09 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0917  hypothetical protein  26.49 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  32.65 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  38.3 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3178  hypothetical protein  25.62 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.82146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3584  hypothetical protein  32.77 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  29.92 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>