30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0753 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  35.57 
 
 
214 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  32.28 
 
 
197 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  30.89 
 
 
194 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  30.69 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  29.67 
 
 
197 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  28.79 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  29.93 
 
 
197 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  37.86 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  34.17 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0688  hypothetical protein  38.05 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04400  hypothetical protein  31.15 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0919  hypothetical protein  27.89 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000270991  unclonable  1.59322e-23 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  28.5 
 
 
199 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  28.65 
 
 
196 aa  67  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  35.14 
 
 
197 aa  67  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  26.84 
 
 
196 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  27.57 
 
 
196 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3178  hypothetical protein  29.86 
 
 
228 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.82146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  32.12 
 
 
208 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  23.73 
 
 
197 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  29.21 
 
 
209 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  24.26 
 
 
267 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  26.45 
 
 
204 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2592  hypothetical protein  22.28 
 
 
195 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.116352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  37.31 
 
 
187 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3584  hypothetical protein  25 
 
 
193 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  41.54 
 
 
211 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0917  hypothetical protein  32.56 
 
 
176 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>