30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0840 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  73.1 
 
 		 197 aa  299  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  73.6 
 
 		 199 aa  289  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  69.04 
 
 		 197 aa  279  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  70.83 
 
 		 194 aa  278  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  71.07 
 
 		 197 aa  267  8e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  63.96 
 
 		 197 aa  226  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  32.61 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  29.67 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  30.43 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.75 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0387561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  29.32 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  29.92 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  30.43 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  29.13 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  25.36 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  30.67 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  29.93 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0630  hypothetical protein  29.94 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313929  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  25.14 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0917  hypothetical protein  32.28 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  27.78 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  25.42 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  27.34 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  26.72 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3178  hypothetical protein  26 
 
 		 228 aa  45.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.82146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  24.17 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0688  hypothetical protein  31.88 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26780  hypothetical protein  29.13 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.576099 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2592  hypothetical protein  25.81 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.116352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>