24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1055 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  100 
 
 
199 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0387561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  39.77 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26780  hypothetical protein  39.9 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.576099 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  36.99 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  36.62 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  35.17 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  31.53 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  31.41 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  33.87 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  33.79 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  33.16 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  35.67 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  32.98 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  33.14 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  31.43 
 
 
267 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  31.46 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  46.61 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  30.56 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  29.67 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  28.33 
 
 
196 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  28.43 
 
 
214 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  31.45 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1317  hypothetical protein  28.95 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  24.75 
 
 
304 aa  42  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.363396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>