26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_716 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  95.41 
 
 		 196 aa  377  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  92.86 
 
 		 196 aa  367  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  29.95 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  33.56 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  28.8 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  27.87 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  27.33 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  26.84 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  28.87 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  28.19 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  32.89 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  30.43 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  30.81 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3584  hypothetical protein  29.94 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  36.62 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  28.34 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  29.08 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  24.7 
 
 		 267 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  32.31 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  29.71 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  25.93 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  29.1 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  33.85 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04400  hypothetical protein  26.47 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>