28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0957 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  73.1 
 
 
197 aa  307  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  71.5 
 
 
194 aa  287  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  70.56 
 
 
197 aa  286  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  68.02 
 
 
199 aa  271  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  70.56 
 
 
197 aa  271  7e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  66.5 
 
 
197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  32.28 
 
 
304 aa  87.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  28.8 
 
 
214 aa  82  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  33.58 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  28.42 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  30.08 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  29.92 
 
 
267 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  26.63 
 
 
204 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  30.14 
 
 
187 aa  61.6  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.41 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0387561  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  30.71 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  28.26 
 
 
208 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  31.69 
 
 
196 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  32.31 
 
 
196 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  34.52 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  27.12 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  34.4 
 
 
224 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26780  hypothetical protein  32.03 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.576099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  27.56 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0917  hypothetical protein  30.47 
 
 
176 aa  45.1  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0630  hypothetical protein  28.22 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313929  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0688  hypothetical protein  35.48 
 
 
232 aa  41.6  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>