26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2401 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  35.57 
 
 
304 aa  93.6  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  32.61 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  29.61 
 
 
194 aa  85.1  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  28.8 
 
 
197 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  31.38 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  27.66 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  28.8 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  34.04 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  29.12 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  28.27 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  24.14 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  29.9 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  28.87 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  22.35 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  30.07 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  29.07 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  30.5 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  29.29 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04400  hypothetical protein  29.17 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  30.16 
 
 
197 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0688  hypothetical protein  29.44 
 
 
232 aa  55.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0630  hypothetical protein  32 
 
 
204 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313929  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4216  hypothetical protein  24.23 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.559313  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2592  hypothetical protein  21.99 
 
 
195 aa  45.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.116352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.53 
 
 
199 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0387561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>