26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0812 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  100 
 
 		 196 aa  385  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  92.86 
 
 		 196 aa  367  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  91.33 
 
 		 196 aa  362  2e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  36.24 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  31.82 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  30.57 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  29.69 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  32.28 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  28.65 
 
 		 304 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  28.49 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  29.9 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  31.95 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  29.33 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  29.13 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  29.63 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  28.19 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3584  hypothetical protein  30.05 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  30.71 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  36.62 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  26.95 
 
 		 267 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  26.46 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  29.73 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  27.56 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  33.85 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04400  hypothetical protein  27.64 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>