27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0732 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  390  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  95.41 
 
 
196 aa  377  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  91.33 
 
 
196 aa  362  2e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  31.28 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  29.32 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  33.56 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  27.87 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  28.27 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  28.49 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  30 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  27.57 
 
 
304 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  31.02 
 
 
224 aa  61.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  29.92 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  28.19 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  31.4 
 
 
204 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  31.33 
 
 
194 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3584  hypothetical protein  29.65 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  36.62 
 
 
211 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  29.79 
 
 
197 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  25.9 
 
 
267 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  31.69 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  25.81 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  29.13 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  31.03 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  24.31 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04400  hypothetical protein  26.47 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0688  hypothetical protein  26.49 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>