23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2871 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  36.51 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  32.82 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  35.87 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  33.52 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  37.07 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  31.02 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  29.29 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  29.63 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  28.34 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  30.67 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  34.4 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  28 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  31.15 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  29.59 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  31.06 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  26.28 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0386  hypothetical protein  32.46 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3584  hypothetical protein  31.91 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26780  hypothetical protein  30.56 
 
 		 202 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.576099 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  29.51 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0444  hypothetical protein  35.34 
 
 		 191 aa  42  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  31.58 
 
 		 204 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.406339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>