30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6136 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  37.28 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  40.11 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  39.2 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  46.34 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26780  hypothetical protein  40.35 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.576099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  34.27 
 
 		 267 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  34.25 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  32.42 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  31.87 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  31.38 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  28.74 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  28.79 
 
 		 304 aa  61.2  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.85 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0387561  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  38.04 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  31.58 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  26.95 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  27.84 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  24.82 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  25 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2592  hypothetical protein  31.85 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.116352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  32.81 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0917  hypothetical protein  29.33 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3584  hypothetical protein  32.6 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  25.58 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  27.34 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  36.61 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  25.17 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  29.94 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.78 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0167377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>