30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1509 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  387  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  41.62 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  42.21 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  35.58 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  36.65 
 
 
267 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  40.7 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  31.28 
 
 
196 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  39.63 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26780  hypothetical protein  42.86 
 
 
202 aa  85.9  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.576099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  30.57 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  29.95 
 
 
196 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  31.82 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  36.41 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  34.04 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  34.17 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  28.42 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  33.51 
 
 
209 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  27.14 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  30.53 
 
 
194 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  37.5 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  25.81 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  25.27 
 
 
197 aa  55.5  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  28.42 
 
 
199 aa  52.8  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  30.19 
 
 
197 aa  51.6  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.19 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0387561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0919  hypothetical protein  27.33 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000270991  unclonable  1.59322e-23 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3584  hypothetical protein  28.32 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3178  hypothetical protein  27.15 
 
 
228 aa  42.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.82146 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0917  hypothetical protein  25.87 
 
 
176 aa  41.6  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  32.77 
 
 
187 aa  41.6  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>