19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3584 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3584  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  377  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  81.77 
 
 		 209 aa  303  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  42.05 
 
 		 213 aa  147  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  29.73 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  29.73 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  32.83 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  30.81 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  33.61 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  32 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  32.1 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  25.97 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  34.71 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  31.55 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  36.97 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  30.22 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  29.5 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  25.38 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  29.23 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  33.61 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>