28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0630 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  384  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  70.05 
 
 
197 aa  276  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  66.5 
 
 
197 aa  261  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  63.96 
 
 
197 aa  258  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  63.45 
 
 
194 aa  254  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  65.62 
 
 
199 aa  246  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  61.93 
 
 
197 aa  230  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  36.24 
 
 
304 aa  84.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  28.49 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  29.55 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  33.57 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  32.09 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  32.96 
 
 
196 aa  61.6  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  30.19 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  33.1 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  31.17 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  31.58 
 
 
196 aa  58.9  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  32.37 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  31.25 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  27.34 
 
 
267 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3815  PAP2 superfamily domain-containing protein  31.01 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0917  hypothetical protein  31.45 
 
 
176 aa  47.8  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.8 
 
 
199 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0387561  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26780  hypothetical protein  32.8 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.576099 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  32.03 
 
 
224 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0630  hypothetical protein  30.82 
 
 
204 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313929  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3178  hypothetical protein  23.44 
 
 
228 aa  41.6  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.82146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>